基于EF1-α基因对常见禾本科作物的聚类分析.pdfVIP

第44卷第2期 郑州大学学报(理学版) V01．44No．2 2012年6月 Univ．(Nat．Sci．Ed．) Jun．2012 J．Zhengzhou DoI：10．3969／j．issI∥1671—6841．2012．02．024 基于邪1．口基因对常见禾本科作物的聚类分析 押辉远1’2， 李卫涛1， 王卫东2， 焦 贞2 (1．洛阳师范学院生命科学系 河南洛阳471022； 2．郑州大学河南省离子柬生物工程重点实验室河南郑州450052) 摘要：基于EFl。o基因核苷酸序列和氨基酸序列，利用分子进化遗传分析软件MEGA5．0构建常见禾本科植物的 最小进化法(ME)、邻接法(NJ)和算术平均数的非加权成组配对法(uPGMA)分子系统进化树．研究结果表明， EFl．o cDNA序列和氨基酸序列的聚类分析都能够反映所列禾本科植物的属间关系，3种进化树的聚类分析分支情 况基本一致．基于EFl一n基因的cDNA序列和氨基酸序列构建的ME、NJ树适合用来研究禾本科作物种间或种内的 遗传关系，而构建的氨基酸序列UPGMA树有待更多的数据研究， 关键词：延伸因子EFl一血；禾本科作物；分子系统进化树 中图分类号：Q37 文献标志码：A 文章编号：167l一684l(2012)02—0108—06 0 引言 禾本科(Poaceae)植物是单子叶植物(0rchidaceae)中的第2大科，有近700属，约1l000种．我国有190 nes砌Mm 多属，1200多种¨o．不仅包括了水稻(O郴oso￡如口L．)、小麦(ni斑um L．)和玉米(zeomn”L．)三 大粮食作物，还包括高粱(嘞甜m‰g弼冼)、甘蔗(＆c如口形mL)等其他重要经济作物，其中一些杂草是生 态学的优势物种和先锋植物拉J．然而禾本科的亚科和族的划分一直存在较大争议：C1ayton等o3。将禾本科分 3通 过对质体DNA和核DNA数据分析及结合形态学的方法将禾本科划分成12个亚科． 随着分子生物学的发展，基于基因序列的分子数据已被广泛应用于物种分类学、系统学和种群遗传学的 研究中．植物延伸因子En一口是真核生物细胞内的第二大蛋白，并且在蛋白质合成延伸过程中起重要作 用净1．许多禾本科植物如大麦、玉米、小麦、水稻等的露Fl一。互补DNA(complementDNA，cDNA)序列已经测 定，通过比较分析多种植物的En—n基因编码的氨基酸序列，发现种间的EFl—o基因编码的氨基酸序列高 度保守，同源性高于95％川，适合用于种系发生分析，可以作为研究系统发育的有力工具哺J．目前，依据形态 学、不同来源(核基因组、叶绿体基因组或线粒体基因组)的基因序列开展的禾本科植物系统分类研究获得 的结果也都有所差异，而基于En—n基因对禾本科植物分类的研究少有所见．作者对水稻、小麦、大麦(舶卜 de“m秽M留ore)、玉米、芒(Misc帆觑黜sine瑚瓠)、发草(D∞c矗口唧sioonf。埘ic口)等禾本科植物的E，l—o基因核苷 酸和氨基酸序列进行比对分析，构建分子系统进化树．旨在进一步了解禾本科植物之间的进化亲缘关系，为 禾本科植物种属间的分类提供确切的分子生物学依据． 1材料和方法 1．1 材料 本文中所有EFl·Ⅱ序列信息来自NCBI(http：／／www，ncbi．nlm．nih．gov／)． s口￡i口n n删i秽Mm 本研究所用植物材料如下：水稻(D甲o L．)、小麦(n娩“m L．)、玉米(zeom口弘L．)、大麦 收稿日期：20ll—12一】I 基金项目：国家自然科学基金资助项目，编 作者简介：押辉远(1977一)，男，副教授，博士，主要从事分子遗传学与生物物理学研究，E-．nail：yahuiyuan@yahoo．c