PCR扩增IS6110在结核病检测和流行病学中的应用评价.pdfVIP

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巾国人蒜共患病学报 276 2008,24(3) ChineseJournalofZoonoses 文章编号:1002—2694(2008)03—0276—02 赵鸯云(综述),朱玲(审棱 中图分类母:R52文献标识码:A 疆入露魏6110(IS6110)是绪狻分支释鏊嫠嚣缓孛懿一除了七述壹接捡溅扩增产耪驻终,还有pe辩现lSA,金标洼 等延伸技术检测绪核杆菌。 个多拷贝鹃保守片段。Thierry等猩1990年蕾先报道了结 核分支杆蔚一个插入序列的核苷酸顺序,并命名为IS6110。2 PCR+RFLP用午细菌分型和流行病学调查 IS6110中禽凑I bp豹发悫末端重复 基予基嚣缰中IS6110撬入痔歹蚝的数藤程位置豹慧勇霹 361bp的核营酸税28 彦弼,宅袋予插入序搿IS3家族,并盥只存在予结孩分支耔 以区分不弱豹萤撩,并且已被谎明有较高豹分辨率稻较好的 tuberculosiscomplex。MTC)中n’.重复性。因此IS6110一RFLP分型技术被用作结核分枝杆菌 菌复合群(Mycobacteria 该序列在大多数结核分支杆菌分离株中拷贝数较高(大约 基因溅分型的金橼准。限制性片段长度多态性(IS6110- 10~25拿),宅是一耱霹移凄豹逡褥成分,不黼亲本懿莛糠RFLP)分辑是近◆余年来分予流行病学孛斑弱最广豹MTB 之间的IS6110拷贝数j阳在染色俸中位置是高度变异的,假 它在基因缎内发生转位、重复和缺失机率很低,因而不会影 拷贝。为了在不同国家的实骏室之间比较分离株,研究国际 畹宅佟力滚符痰遗传据悫豹援篷∞。垂予其拷煲数较多,农 同一结核秆菌基因组中相对稳定,因此是分子熊物学方法研 方案“∞。1996华攀传友n郎等在国内首次建立了结核杆菌 究结核杆菌的首选片段。本文就该序列在结核杆菌检测中 DNA指纹技术的方法学.他们根据不同来源的结核菌株染 粒应用综述之。 色体DNA中序列IS6110位鬟和数量斡攀弱,以摄入痔残 1 PCR誊绥扩增靶浮秘检测结核秆蔼 IS6110为基础并选取其中一部分片段进行扩增,采潮增强 一般认为。靶序列拷贝数越多.PCR的敏感性越高。因 化学发光标记技术对插入序列IS6110中的PCR扩增产物 为IS6110插入序列的拷贝数约有lO一25个,熙为结核杆德 进行橼记,与结核麟染色体DN酶切、电泳朔转移后鲍产褥 复合群爨特有,爱疆选撵该彦甍终海扩增靶澎梦|j,霹羧褥蘩 进行杂交、检灞,然瑶缀据杂交磊魏DNA酶切蚕谱鄂DNA 较高的敏感性和特异性,从理论上讲应该比单拷贝序列(如 指纹图谱的不同进行株水平的鉴定。从1iii可以分析不同地 MPB64,MTP40)敏感性高10多倍,这从WasiullaRaft。3的 理区域流行的结核分支杆菌的特点,了解菌种的进化,证实 实验孛霹敬褥赘涯鹗,嚣瑟是PCR方法捡溺缨梭舞蓥豹饕 霉疑瓣传接嚣节,滚踪撬橡闼瓣传搔,嚣分复发痰秘擎戆羚 选基因。1989年HanceAJ等“3酋先将PCR技术应用予结 源性稀感染。进行实验室的质嫩控制等。慕于MTB插入序 核分支杆菌检测。从而开辟了以PCR为代表的分子生物学 技术检测、研究结核分支释莹的阶段,接着众多学者依擐 方法建立了一今罄际RFLP数撂疼o”,撵燹数多戆蘩探在 IS6110謦列设计了许多实验方案袋检溅结核杼菌。虽然该 确定流行病学链系时较为为W靠,使得在不同国家。不弼地 序列在基因组中拷贝数较高。但是文献报道睁们PCR方法对 区,甚至不同时间的研究结果舆有了可比性;同时结核瘸流 结核分技桦菌检出的敏感性和特异性有较大差异,这些差异 行病学的研究颁域逐步扩展。为研究晷家内

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