基于概率神经网络的基因选择和组织分类方法.pdf

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基于概率神经网络的基因选择和组织分类方法.pdf

V01.2lNo.1 科技通报 第21卷第1期 Jan.2005 BULLE7ⅡN0FSCIENCEANDTECHNOLOGY 2005年1月 基于概率神经网络的基因选择和组织分类方法 王明怡1,2王德林2,黄金钟3 (1.浙江大学生命科学学院,杭州310029;2.中国计量学院计算机科学与工程学系, 杭州310018;3.浙江大学人工智能研究所,杭州310027) 摘要:提出了基于概率神经网络的微阵列数据分析方法。该方法采用Wrapper模式,将基因选择整合 到组织分类任务中,并给出了采用随机寻优的特征子集搜索算法。实际的生物学实验数据证明该方法 有较高的分类准确性,选择的基因集合与组织类别有较高相关性。 关键词:微阵列;概率神经网络;基因选择;组织分类 中图分类号:TPl81;Q7文献标识码:A 文章编号:1001—7119{2005)01—0010—04 GeneSelectionand TissueClassificationMethodsBasedon ProbabilisticNeuralNetworks WANG NG Ming-yil一,WADe—lind,HUANGJin-zhon92 ofLife of Scienceand (1.CollegeScience,ZhejiangUniversity,Hangzhou310029,China;2.DepartmentComputer ofArtificial Jiliangllniversity,Hangzhou310018;3.Institute Engineering,China Intelligence,ZhejiangUniversity, ‘Hangzhou310027,China) Abstract:A methodbasedon neuralnetworkswas method microarrayanalysis proposed.This probabilistic exploits model and selectionintotissueclassification.Arandom methodforfeature wrapper integratesgene optimization searching selectionisalso data thismethod haveshownthat theaccu- presented.Realbiologicalexperiments significantlyimproves ofclassificationandthe subsetsare correlatedwithdifferenttissue racy resultinggene highly types.

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