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HEREDITAS (Beijing) 2007 9 29(9): 1154 ―1160
ISSN 0253-9772 研究报告
DOI: 10.1360/yc-007-1154
1 1 1,2 1 1,3 1,2
李伟 , 陈怀谷, 李伟 , 张爱香, 陈丽华 , 姜伟丽
1. , 210014;
2. , 210095;
3. , 350002
: 利用公共的真菌基因组数据库资源, 对核盘菌（Sclerotinia sclerotiorum ）和灰葡萄孢（Botrytis cinerea ）
基因组中SSRs 的结构类型、分布、丰度及最长序列等进行了系统分析, 并与已经研究过的禾谷镰孢菌（Fusarium
graminearum ）, 稻瘟病菌（Magnaporthe grisea ）和黑粉菌（Ustilago maydis ）等几种植物病原真菌基因组中的
SSRs 进行了比较。结果表明: 核盘菌和灰葡萄孢基因组中的 SSRs 非常丰富, 分别为6 539 和8 627 个, 并且在
结构类型和分布规律上具有一定的相似性; 与其他几种病原真菌相比, 核盘菌和灰葡萄孢基因组中长重复的
四、五、六核苷酸基序更为丰富, 从而使得这两种真菌具有更高的变异性。同时, 我们发现真菌基因组中SSRs
的丰度与基因组的大小及GC 含量没有必然的关系。文章对核盘菌和灰葡萄孢基因组中 SSRs 的丰度、出现频
率及最长基序的分析为快速、便捷地设计多态性丰富的SSRs 引物提供了有益的信息。
: 核盘菌; 灰葡萄孢; 简单重复序列; 群体遗传学
Analysis of simple sequence repeats in genomes of Scle-
rotinia sclerotiorum and Botrytis cinerea
1 1 1,2 1 1,3 1,2
LI Wei , CHEN Huai-Gu , LI Wei , ZHANG Ai-Xiang , CHEN Li-Hua , JIANG Wei-Li
1. Institute of Plant Protection, Jiangsu Academy of Agricultural Sciences, Nanjing 210014, China;
2. College of Plant Protection, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095, China;
3. School of Life Sciences, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou 350002, China
Abstract: Simple sequence repeats or microsatellites have been used as genetic markers in population genetics because of
their abundance and length variation between different individuals. This study examined the SSRs in the completely se-
quenced Sclerotinia sclerotioru
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