氨基酸的置换数与生物大分子进化改变量的测度.pdfVIP

氮基酸和生物资源 ^血∞^clds＆Bl撕ck积ir嘲2001．23(3)：l一2 氨基酸的置换数与生物大分子进化改变量的测度 陈文强1，邓百万1，李少宁2 (1汉中师范学院生物系，陕西汉中7粼；2江苏江阴市教师进修学校，214100) 摘要：以蛋白质分子的氨基酸置换数或核酸分子的核苷酸置换数为衡量尺度．说明生物大分子随时闻的改变(即 分子进化速率)保持相对恒定。 关键词：氨基酸的置换散；生物进化；分子进化速率 中图分类号：Q503 文献标识码：A 文章编号：1006—8376(2001)03—000l一02 近年来随着生物科学的研究逐渐深入到数 各个氨基酸每年以平均10’9的比率变化着。 量化的探讨。一方面分析生命现象最基本的遗 换言之，即每个氨基酸要10亿年才改变1次。 传物质的组成，出现了分子生物学和量子生物 在细胞内担任氧化还原的细胞色素c，以血红 学等学科；另一方面，生物不是单纯的由一些细 蛋白的l，3速度在变化。血液凝固时，从血纤 胞堆积而成的集合体，而是由“核酸与蛋白质组 蛋白原脱变成血纤蛋白时所放出的血纤蛋白 成的具有不断自我更新能力的多分子体系”uJ。 肽，比血红蛋白的进化速度快几倍。因此，对于 无论是生物群体和生态系统，或者是细胞和一 某类蛋白质分子或某个核酸来说，其分子进化 些生物大分子，都有其严密的组织，各组成部分 速率可用氨基酸或核苷酸的每个位点每年的置 相互之间又存在着复杂的联系，这样各个不同 换数来进行测度，即K=d／2tN，式中d表示氨基 部分有机地组成一个整体。从生物大分子的层 酸或核苷酸置换数目，N为大分子结构单位(氨 次上来研究生物进化改变时，不同于生物表型 基酸或核苷酸)总数；t为所比较的大分子发生 进化的显著特点之一，就是生物大分子进化速 分异的时间，2t代表进化时问，进化经历的时间 率的相对恒定性。 是分异时间的2倍．则K就是分子进化的速率 如果以蛋白质和核酸的一级结构的改变量 (每个氨基酸位点每年的置换数)’31。例如人和 为衡量尺度，即蛋白质分子的氨基酸置换数或 狗的a一肽链上，有23个位置的氨基酸排列不 核酸分子的核苷酸置换数作为进化改变量的测 同，占总。．肽链氨基酸的16％。如果人和狗是 从同一个祖先分头向不同方向进化，那么对于 度，进化时间以年为单位，那么生物大分子随时 阃的改变(即分子进化速率)与环境变化、群体 人和狗则各进化了8％个氨基酸位点。通过比 较人和狗的同源大分子的差异，人与狗从8000 大小无关。通过对细胞色素c、血红蛋白、肌红 蛋白、血纤维蛋白肽、组蛋白等几十种大分子进 万年开始发生分异(【_80Ma)。假定人与狗的 最近的的共同祖先A生存于8000万年(80Ma) 行分析研究，不同物种中同一种蛋白质的氩基 前，那么人和狗的同源大分子的差异乃是人和狗 酸的进化速率接近恒定”l。如在体内运载氧的 各自独立地进化的结果，每进化1％氨基酸位点 红细胞中的血红蛋白链由141个氨基酸组成， 就需要l千万年。因此，实际上的进化时间是分 收稿日期：2001—O卜25 异时间的2倍(2t=160Ma)，如图l所示。