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浅谈RTPCR实验方法中常见污染问题及对策.pdf

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中国试剂网 3.12.1.14 浅谈RT-PCR 实验方法中常见污染问题及对策 河南出入境检验检疫局技术中心 李轲 反转录-聚合酶链反应(RT-PCR )是一种体外核酸扩增技术,它具有特异、敏感、 快速、简便、重复性好、易自动化等突出优点,能在几个小时内完成从一根毛发、 一滴血、甚至一个细胞中扩增出足量的目的产物供分析研究和检测鉴定,所以近 年来RT-PCR 技术被广泛应用于人和动物的多种传染病早期诊断。笔者一直从事 实验室动物疫病检测工作,现就应用RT-PCR 实验方法过程中出现的一些常见污 染问题做如下论述,仅共同行参考和探讨。 RT-PCR 实验有三步:提取RNA 、 反转录(RT )、PCR 扩增及扩增产物分析,在这一过程中,最令人头痛的问题是 易污染,极其微量的污染即可造成假阳性。污染原因主要有以下几个方面: 1 、 样品间的交叉污染收集样品的容器最好使用一次性的,如重复使用,应在使用前 应于180℃的高温下干烤6 小时或更长时间;样品存放时要密封严实,以防外溢 造成相互间的交叉污染;样品在提取过程中离心管及吸样枪头最好使用一次性 的,以免不同实验样品间相互污染;由于吸样枪污染会导致样品间的污染,也是 一个值得注意的问题,由于操作不慎将样品或提取物吸入枪内或粘上枪头是一个 严重的污染源,因而加样或吸取时要十分小心,吸时要慢,吸取尽量一次性完成, 忌多次抽吸,以免交叉污染或产生气溶胶污染;同时要注意操作时不要剧烈地摇 动反应管,开盖时也容易造成气溶胶污染。若产生气溶胶较多,会造成环境污染, 不仅会导致实验失败,而且也会损害操作人员身体健康,因此每次实验完毕都要 及时清理实验台面,用 0.5%次氯酸钠消毒后再打开紫外灯照射半小时。 2 、 RT-PCR 本身使用的试剂污染在试剂配制过程中,由于加样枪、容器及其它溶液 被污染。因此所有试剂都应尽量小量分装,以减少重复加样次数,避免污染机会, 另外RT-PCR 试剂应尽可能密封好分类存放。每次操作完毕后同样要进行台面消 毒和紫外线照射消毒。 3 、扩增产物的污染这是实验中最常见的问题,极微量的 扩增产物污染就可造成假阳性,每次实验完后,扩增产物都要及时密封后处理。 在做RT-PCR 实验时,一般都应设阳性对照,操作不慎,污染可能性很大,因而 当某一RT-PCR 试剂经自己使用稳定,检验人员经验丰富心中有数时,在以后的 实验中可免设阳性对照,或间隔性设阳性对照,以减少污染机会。 4 、操作人员 污染只要存在少量的RNA 酶就会引起RNA 的降解,从而影响结果的准确性, 中国试剂网 3.12.1.14 RNA 酶可存在操作人员手汗、唾液中,也可灰尘中,一旦器械、玻璃制品、塑 料制品受到污染,容易造成实验失败,因此操作人员应戴一次性口罩、帽子、手 套,实验过程中手套要勤换,。设置PCR 操作专用实验室,所用实验用具应为专 用,并合理分隔实验室,将样品的提取、配制RT-PCR 反应液、PCR 循环扩增等 步骤分室进行,实验前应将实验室及实验人员工作服用紫外线或臭氧消毒以破坏 残留的 DNA 或 RNA 。任一种科学的实验方法都有其自身完善和发展的过程, RT-PCR 方法也不例外,在检测质量能保证的情况下,若能简化样品提取步骤或 缩短其时间,减少扩增循环次数,都能对防止污染有利。总之,RT-PCR 不管从 特异性方面还是从灵敏性方面讲都具有难以匹敌的优势,结果的可靠性和可信性 应该是最好的,是较具权威性的检测方法,我们期待着它能尽快地自身完善和发 展。

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