浅谈系统生物学教学.pdfVIP

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20 ±鱼查墼堡 查圭 !Q墨鼻22卷第5期(总第175期) 浅谈系统生物学教学 广东南方医科大学生物技术学院抗体工程研究所(510515) 杨学习 徐伟文 摘要 系统生物学是研究一个生物系统中所有组成成分的构成 ,及在特定条件下这些组分间相互关系的学科。随着基因组、蛋白质组、代谢组等各种组 学的迅速发展,系统生物学也成为当前生物学研究的热点,代表着21世纪生物学发展的方向。系统生物学从生物发展的规律和分子的水平揭示和解释 “生命是什么”这一生物学最奥妙的问题。因此在生物学专业本科生开展系统生物学课程的学习十分重要,它不仅给生物学教学注入了适应生物学发展 的新内容,推进交叉学科发展,同时,激发学生对生物学学习的热情。 关键词 系统生物学 生命是什么 生物学教学 中图分类号:G642.4 文献标识码 :A 文章编号:1818-6539(2010)05一(0020)一(02) 生物学是研究生命现象和生物活动规律的科学。在生物学没 间。系统生物学把细胞看作是既有分子属性又有细胞属性、有组 有出现之前和发展初期,人们为生命世界的绚丽多彩而迷惑不 织或正在形成组织的分子系统。它所关注的是生命或其功能属 解,“生命是什么”这一生物学最基本的问题自然产生。这时的人 性 ,是分子与细胞之间的关系,是如何在分子行为基础上解释和 们认为生命和无生命是截然不同、毫无联系的两个领域。相信生 预测细胞行为。系统生物学的目标是理解生物体的功能属性与行 命并不遵守无生命物质的运动规律,而是一种非物质的力 ,即 “活 为是如何通过其组成部分的相互作用实现的。这些相互作用是怎 力”的作用。随着生物学的发展和对生命现象认识的加深,人们抛 样在动力学上非线性、在组织上不均一的过程中涌现新的性质或 弃了 “活力论”,认识到生命也是物质的一种运动形态。生命的基 功能。所以系统生物学为解决 “生命是什么”这一生物学最基本同 本单位是细胞,是由蛋白质、核酸、糖类等生物大分子组成的一个 题提供了可能途径。 复杂系统。生命现象就是这一系统中物质、能和信息综合运动与 系统生物学的产生有两个根源:“组分根源”和 “系统根源” [3] 传递的表现。 。 组分根源主要起源于生物化学和分子生物学。对于生物体的 现代生物学已经成为一个具有众多分支学科的庞大的知识 组分研究,不同于生物化学和分子生物学仅关心一个或几个的基 体系。其中以还原论为学科基础的生物化学和分子生物学分别在 因和蛋白质 ,系统生物学针对有机体中所有基因、所有蛋白质及 30年代和50年代兴起并成为生物学的前沿与生长点。还原论的 组分间的所有相互关系进行研究。“组分根源”随着能够对生命系 方法学认为各部分组成整体 ,并由此决定了整体的性质,认为通 统的所有组分在性质辨别和浓度测定方面进行全面分析的各种 过分解系统并研究系统各部分的性质就能理解整个系统,根据这 高通量技术(组学、生物信息学和高通量生物技术)的出现而达到 种思维模式,产生了强大的研究方法并取得了令人惊叹的丰硕成 顶点。“系统根源”来 自于贝塔朗菲(Bertalarrffy)创立的”一般系统 果。基因组测序、蛋白质组学、转录组学和代谢组学的各种高通量 论”。贝塔郎菲多次强调生物学中有机体概念,提出把有机体当作 技术的发展,使我们能够对完整生命系统的所有组分的性质和浓 一 个整体或系统来研究,这一整体是由相互作用和高度组织的各 度进行全面的分析…。然而,分开研究生命系统的全部分子就可 组分整合而成的。整体具有的一些功能属性并不存在于组分本 以理解活细胞或了解生命了吗?其实对生物体或者活细胞进行哪 身 ,而产生于许多组分同时发生的相互作用,即整体大于部分之 怕最轻微的分解 ,也基本去除了其与生命有关的所有性质。只从 和。系统生物学恰恰是以整体性研

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