一种新型钙调素结合蛋白-金属蛋白酶在龙须菜高温胁迫中的表达模式的研究.pdfVIP

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  • 2015-10-03 发布于安徽
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一种新型钙调素结合蛋白-金属蛋白酶在龙须菜高温胁迫中的表达模式的研究.pdf

谨以此论文献给给予我无私支持的父母,对我严格要求的 导师和长期帮助我的同学 ——龚乐 万方数据 万方数据 万方数据 一种新型钙调素结合蛋白-金属蛋白酶在龙须菜高温胁迫中的表 达模式研究 摘 要 龙须菜(Gracilaria lemaneiformis)是一种重要的产琼胶经济海藻,原产于山东和辽 宁,在我国已成为继海带和紫菜后的第三大栽培海藻。随着龙须菜栽培业的不断发展, 对龙须菜种质提出了更高的要求,研究者们先后选育出耐热品种981 和07-2 ,使得龙须 菜品质得到了不断改良,其耐高温性能也不断提高,带来了巨大的经济效益和社会生态 效益。然而,在龙须菜大规模栽培中,这两个耐高温品系也出现了种质退化现象,为此, 迫切需要研究龙须菜在高温胁迫下的响应机制,为选育性状优良、耐高温性强的龙须菜 新品系奠定基础。 实验室前期通过酵母双杂交系统筛选高温胁迫条件下钙调素(CaM )结合蛋白,得 到了金属蛋白酶(metalloproteinase of Gracilaria lemaneiformis , GlMP )的表达序列标签, 表明金属蛋白酶可能是龙须菜CaM 信号传导途径中的一员,在龙须菜响应高温胁迫中 发挥作用。本论文在此基础上,首次克隆龙须菜的GlMP 基因,并研究其在高温胁迫下 的表达模式,为探讨龙须菜对高温胁迫下的信号传导途径打下基础,并为龙须菜耐高温 品系的选育提供可用的基因信息。 本研究以野生型、981 和07-2 三种龙须菜为实验材料,通过RACE 技术和Genome Walking 方法,首次克隆了龙须菜中GlMP 基因的cDNA 和DNA 序列全长。结果表明, 克隆得到的龙须菜GlMP cDNA 全长546bp ,包括462bp 的开放阅读框,36bp 的5’ UTR 以及48bp 的3’ UTR 。开放阅读框编码153 个氨基酸,其中包括金属蛋白酶的Zn2+保守 结构域HEXXH 。克隆得到的龙须菜GlMP 基因全长1123bp ,其中包含5’端侧翼序列 542bp,以及一个长约71bp 的内含子。比较发现野生型、981 和07-2 三种龙须菜中GlMP 的序列无差异。Southern 杂交结果表明无论是野生型、981 还是07-2 ,基因组中均含有 2 个拷贝GlMP 基因。利用酵母双杂交技术检测表明,GlMP 可以与CaM 相互作用,是 一种钙调素结合蛋白。 通过比较3 种龙须菜中GlMP 和CaM 的表达水平发现,野生型龙须菜中GlMP 的 表达水平高于981 和07-2 龙须菜,981 龙须菜中CaM 的表达高于其余2 种品系,而3 种龙须菜的耐高温性能是07-2981野生型,可见耐高温性能并不是由单一因子表达水 平决定的,可能与多种耐高温因子及它们之间的协同作用有关。龙须菜中GlMP 和CaM 万方数据 均在32°C 表达高于28°C,表明它们都可以对高温胁迫积极响应。 此外,本论文以CaM 为诱饵,通过酵母双杂交筛选到39 条CaM 结合蛋白的基因, 经生物信息学分析发现,这些基因多为蛋白酶类,参与各种水解、氧化还原、脱羧等反 应,并且其蛋白质的二级结构符合钙调素结合域(CaMBD )的特点。根据钙调素结合 蛋白(CaMBP )数据库分析本研究获得的GlMP 氨基酸序列,发现其82-123 位具有 CaMBD 结构域的特点,推测为钙调素结合区域,为了验证该区域,本研究将GlMP 的 氨基酸序列分为4 部分-CaMBD 部分(表示为Most ),CaMBD 上游部分(表示为Front ), CaMBD 下游部分(表示为Last )和全长GlMP (表示为Whole ),分别将这四部分与 CaM 采用酵母双杂交进行验证,结果显示Most 和Whole 部分菌落变蓝,而Front 和Last 部分没有变蓝,表明软件预测的GlMP 中82-123 位的氨基酸区域是CaMBD,GlMP 是 一种钙调素结合蛋白。

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