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氢键质子的运动与胞嘧啶的变异几率

第 24卷 第 2期 原 子 核 物 理 评 论 Vo1.24,No.2 2007年 6月 NuclearPhysicsReview June,2007 文章编号:1OO7—4627(2OO7)o2一OO98一o5 氢键质子的运动与胞嘧啶的变异几率 赵振民 ,张启仁 ,高春媛 ,卓益忠 (1北京大学物理学院,北京 100871; 2中国原子 能科学研究院,北京 102413) 摘 要:运用Gaussian98MP2/6—311G(d,p)级 的从头计算法计算 了DNA分子 中胞嘧啶碱基 中 H13质子的势能曲面。发现有两个势阱:其中一个对应正常的胞嘧啶,而另一个则对应它的顺式亚 胺式互变异构体。质子在这两个势阱的束缚对热扰动是稳定的。质子在势阱中像单摆一样绕着离它 最近的氮原子摆动,还可以远离氮原子与其它碱基形成氢键。估算 出的H13质子从一个势阱到另 一 个势阱的穿透几率表 明质子呆在其中一个势阱中的寿命大约是6×10a,这使胞嘧啶和它的顺式 亚胺式互变异构体在室温气相实验 中远不能达到热平衡。对这些结果的生物学意义作 了讨论 。 关 键 词 :氢键质子;势能曲面;隧道效应 中图分类号 :Q319 .3;Q526;0641.11 文献标识码 :A 1 引言 … C配对 。进一步复制又会导致 T…A,C。i。…A, C…G和 C…G配对。这样一来 T…A 对就 出现在 氢键质子穿透分隔正常态和病态的势垒的隧道 了原来 c…G对的位置上。这是遗传密码的改变, 效应会引起 DNA碱基改变,Lowdin于 4O多年前 因此后果严重。它可能影响生物系统 的发育和繁 据此提出了一个研究突变、衰老和癌症形成 的方 殖 ,例如会导致衰老、癌症和变异 。在定量理论物 案[1]。其后一段时间内,限于理论化学方法和计算 理水平上理解和研究这些过程是非常有意义的。 能力的不足 ,这个诱人 的方案未能实现。而今从头 计算理论以及它的软件包都 日益成熟,也有了高性 I H o\ Nl \ l—Hl3…。。5\\ /N7cH 能的计算机 ,为实现这个方案提供了条件。沿着这 、 / \\Cl / — 个方向已经有了许多工作 。文献 [2]一[15]是一些 CC66一一 C1 l— C6 l

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