多胺脒类药物小分子和DNA相互作用的理论的研究.pdf

摘要 摘要 基因药物的出现可以使人们征服一切疾病，因此，基因药物一直是科研工 作者研究的热点领域。多胺类药物小分子良好的生物活性使其成为基因药物领 域研究的热点之一。本论文主要是研究多胺脒类药物小分子与DNA的相互作用。 主要由两部分组成：第一部分是多胺脒类药物小分子与DNA结合模式的探索； 第二部分是对称性可逆脒与DNA的结合模式和构像动力学的理论研究。 第一部分内容是探索多胺类药物小分子与DNA最佳结合模式的分子对接研 究。本论文选取有代表性的多胺类小分子DB75和DB293，对这两个分子的不 同部位进行修饰，共得到42个多胺类小分子，采用分子对接的方法研究这些药 水平上对多胺类小分子进行了全参数优化，继而计算其RESP电荷，最后采用分 子主要结合在双链DNA的小沟内，最佳结合位点在AT富集区。进一步数据分 析发现，影响多胺小分子结合能力的因素主要有四个：分子弯曲弧度、所带电 荷、中心杂环和分子长度。多胺分子的弯曲程度越接近于DNA曲率，其结合能 力越强；分子所带电荷越多越有利于增强其与DNA的静电作用力；分子中心杂 环的类型决定了其与DNA碱基间形成的关键氢键能否存在：分子的长度对其与 DNA的范德华