人淀粉样胰多肽在磷脂双层膜表面吸附和取向的分子动力学模拟研究.pdfVIP

扉页 指导老师 韦广红 教授 万方数据 目录 擅要…………………………………………………………………………………………………………………………………V 第一章绪论…………………………………………………………………………………………1 §1．1引言……………………………………………………………………………………………1 §1．1．t淀粉样蛋白的研究背景……………………………………………………………～1 §I．1．2蛋白质的错误折叠、聚集与疾病…………………………………………………．．2 §1．1．3研究目的与意义……………………………………………………………………～3 §1．2 hlAPP介绍……………………………………………………………………………………3 §1．2．1蛋白质结构与性质…………………………………………………………………一3 §1．2．2hIAPP的结构………………………………………………………………………．．6 §1．2．3 hlAPP可能的致病机理……………………………………………………………．．8 §1．3 POPG／POPC介绍……………………………………………………………………………………………………11 §1．3．1 磷脂分子的结构与性质……………………………………………………………11 §1．3．2 POPG／POPC的结构………………………………………………………………．．14 §1．4 hIAPP与POPG／POPC的作用…………………………………………………………………．15 第二章研充方法及分析方法……………………………………………………………………。18 §2．1分子动力学模拟方法………………………………………………………………………18 §2．1．1分子动力学原理……………………………………………………………………18 §2．1．2周期性边界条件……………………………………………………………………19 §2．1．3分子动力学算法……………………………………………………………………20 §2．1．4能量优化方法………………………………………………………………………21 §2．1．5温度压强耦合………………………………………………………………………23 §2-2经验力场的介绍……………………………………………………………………………25 §2．3分析方法……………………………………………………………………………………27 第三章hIAPP单体吸附蓟带负电POPG膜过程的分子动力学研宄……………………………29 §3．1 h认PP单体与POPG模拟体系……………………………………………………………．29 §3．1．1 hlAPP单体与POPG体系搭建及环境设置………………………………………29 §3．1．2模型及算法参数设置………………………………………………………………30 §3．2模拟结果及分析……………………………………………………………………………31 §3．2．1 hlAPP单体从水溶液到POPG膜表面吸附过程…………………………………31 §3．2．2 hlAPP单体在POPG膜表面的吸附面……………………………………………37 §3-2．3能量分析……………………………………………………………………………38 §3．2．4磷脂尾巴序参量分析………………………………………………………………39 §3．2A膜环境hlAPP聚集的可能机理……………………………………………………41 §3．3结论……………………………………………………………………………………………4l