大环芳香配配合物对正常和错配dna结构识别作用的分子模拟.pdf

博士论文 山西火学 主要创新点 拟研究工作基础上，本文发展并完善了一套分子模拟方法用以研究此类大环芳香配体 中的主要创新点如下： 1．发展并且完善了一套利用分子模拟方法研究此类大环芳香配体配合物对 DNA的结构识别作用。多次对此类识别体系的模拟研究工作证实，该方法可以成功 的重现国际上已经发表的实验结果，同时能够突破现象学的限制对识别作用从原子水 平上进行深入分析其作用机理。 2．通过对一系列识别体系的分子模拟研究，我们对国际上关于类似识别体系作 作用能量的角度进行了分析。然后在对导致争论的因素进行解释的基础上，针对不同 作用体系(正常和错配)提出了新的作用机理。在关于正常序列的沟选择性识别问题 上，我们支持瑞典Norden教授工作组的结论，认为应该是从小沟插入占优势；而在 手性选择性上，我们认为可能是由于能量差异不大，实验手段的局限性导致了争论的 产生。而在导致识别特异性的因素方面，我们发现，应该是静电作用而不是范德华相 互作用占主导地位。这就意味着，为了提高识别特异性，识别体系的形状导致的静电 分布情况可能比空间阻力作用更重要。 了部分实验上没有得