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植绥螨系统关系巴氏新小绥螨不同群体分析
摘要
摘 要
本论文基于ITS基因序列对植绥螨科17种植绥螨类群的系统发育关系进行
了探讨,并使用ISSR分子标记对巴氏新小绥螨的居群遗传多样性进行评估,分
析和探讨了其居群遗传结构和种群差异。主要研究内容和结果有以下两个方面:
l、植绥螨的分子系统发育分析
本文通过对17种植绥螨ITS基因序列(包括实验所测得四种植绥螨ITS基因
序列及从Genbank中所获得的13种植绥螨ITS序列)的比对分析,探讨其属间,
种间的系统发育关系。
实验所测四种植绥螨ITS片段J¨-T平均含量为57.63%,、G+C平均含量
简约信息位点20个。ITS2区段包含变异位点16个,简约信息位点2个。5.8S
区段的变异位点和简约信息位点则较少分别为8个和1个。17种植绥螨的ITS
1区段含有变异位点
片段√坩平均含量为57.5%,G吒平均含量为42.5%。ITS
214个,简约信息位点137个。ITS2区段则包含变异位点44个,简约信息位点
12个。相对于这两个区段5.8S区段的变异位点和简约信息位点则较少分别为19
个和4个。碱基的插入觖失主要集中在ITSl区段,ITS2与5.8S区段的序列插
入/缺失相对较少。三个区段中5.8S区段表现出很高的保守性。在17植绥螨中,
碱基转换/颠换最多的是肱occidental括,碱基插入/缺失则是Z
pyri最多。
通过ITS分子系统树显示,小新绥螨属和小植绥螨属亲缘关系较近,伊绥
螨属则与真绥螨属亲缘关系较近。MP与NJ树都显示,静走螨属独立为一支,
与其它各属亲缘关系较远。分子系统树显示,钝绥螨属的草栖钝绥螨划入真绥
螨较多的一支,钝绥螨属的津川钝绥螨和A.alpinus划入新小绥螨较多一支。基
于ITS基因序列构建的分子树显示该7属间关系为:{【(小新绥螨属+部分钝绥螨
属)+小植绥螨属】+[(真绥螨属+部分钝绥螨属)+伊绥螨属)】+盲走螨属)+静走螨
属。
本文中所探讨的17种植绥螨为同一科不同属,利用ITS基因序列能较好地
构建其分子系统树,了解其亲缘关系,这也说明ITS基因能较好地解决植绥螨
属内种间低级阶元的系统发育关系。
2、巴氏新小绥螨居群遗传多样性分析
摘要
0.625I-tL,Primer
增体系TaqDNA聚合酶0.20}tL,MgCl21.5此,dNTPsO.25皿,
10xPCR
Buffer 4p.L,ddH2015.925I_tL,总体积25此。
2.5pL,模板DNA
行ISSR.PCR扩增,产生52条带,其中22条为多态性条带,多态性条带百分比
1%。
(PPB)达到42.3
望杂合度He对居群遗传多样的评价结果相一致:安远居群的遗传多样性高于大
余与信丰,大余与信丰两地的居群则遗传多样性差异不显著;
(4)居群遗传结构和基因流:居群间的遗传分化系数Gst--0.6810,说明大部
分的遗传多样性分布在居群内。Nei’S无偏遗传距离UPMGA聚类分析显示3个
居群的关系可表示为大余和信丰两个居群几乎无差异,而安远则与上述两个居
群的亲缘关系相对较远,但差异不大。 .
关键词:植绥螨;ITS基因;系统发育;巴氏新小绥螨;遗传多样性;ISSR
ll
Abstract
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