8-氧-2＇-去氧鸟嘌呤核苷水解机理的理论研究.pdfVIP

第 31卷 第 3期 原 子 与 分 子 物 理 学 报 V01．3l No．3 2014年 6月 J0URNAL OFATClMICANDMOLECULARPHYSICS Jun．2014 doi：103969／j．issn．1000—0364．2014．03．003 8一氧一2，一去氧鸟嘌呤核苷水解机理的理论研究 郑 妍 ，尤 勇，梁晓琴 (四川师范大学化学与材料科学学 院，成都 610066) 摘 要 ：本文用计算化学的方法研究了有单个水分子参与的8一氧一2去氧鸟嘌呤核苷 (8-oxodG)的N一糖苷 键水解反应机理．研 究结果表明，水分子有两个进攻方 向，即水分子可以从去氧核糖糖环的上方和下方 进攻 C1饼 且 8一氧鸟嘌呤碱基的08原子和 N9原子都可以摘取去氧糖环 的Ha2．因此 ，8-oxodG与单个水 分子作用的水解反应有 四条不 同的反应通道 ，且每条反应通道都 包括两步，都形成类双氢呋喃中间体． 08原子摘取去氧糖糖环 Ha2．的反应 的两条反应途径 的第一步的活化 能相近，约为 41．98kcal／mol；而N9 原子摘取去氧糖糖环Ha2的反应 的两条反应途径 的第一步的活化 能也相近 ，约为47．31kcal／mot．碱基上 08原子摘取去氧核糖糖环 Ha2的反应的两条反应途径更具有优势． 关键词 ：8一氧一2去氧鸟嘌呤核苷 ；N一糖苷键水解 ；类双氢呋喃中间体 ；自然键轨道 中图分类号 ：O641．3 文献标识码 ：A 文章编号 ：1000—0364(2014)03—0355—09 Theoreticstudyonhydrolysismechanism of8-oxo一2一deoxyguanosine ZHENG Yan，YOU Yong，LIANG Xiao—Qin (CollegeofChemistryandMaterialScience，SichuanNormalUniversty，Chengdu610066，China) Abstract：Thecomputationalchemistrymethodhasbeenusedtostudythehydrolysismechanism forgly- cosidicbondof8一oxodG involvingasinglewatermoleculeinthisarticle．Theresultindicatesthatthe watermoleculecanattack theC1’atom from twoorientations，aboveorunderthedeoxyriboseringof the8-oxodG，andboth 08andN9atomsinthebaseof8一oxodG canabstractHa2 atom ofthedeoxyri— bosering．So，therearefourdifferentpathwaysforthehydrolysisreactionof8-oxodG andsinglewater molecule．Everypathwayconsistsoftwostepsinvolvingtheformationofadihydrofurane—likeintermedi— ate．Theactivation energiesofthefirststepsinthetwopathwaysabstractingtheHa2by08 atom are similar，whichareabout41．98kcal／mo1．Also，theactivationenergiesofthefirststepsinthetwopath— waysabstractingtheHa2byN9atom aresimilar，whicharealsoabout47．31kcal／mo1．Thetwopath— waysabstractingtheHa2by08atom ofthebasehaveabiggeradvantage． Keywords：8一OXO一2_d