一株野生绿翅鸭H5N2禽流感病毒基因分子进化分析.pdfVIP

论文摘要 A 流感病毒可以分为甲乙丙三种，其中甲型禽流感病毒(InfluenzaVirus)是三种 里面最容易发生变异，并且传染性最大的病毒。禽流感是由甲型流感病毒引起的禽 类疾病，禽流感病毒可以通过很多途径进行传播，是历史比较久的一种病毒，根据 致病性的高低，可以将禽流感病毒分成高、低以及非致病性这三种。 根据病毒表面抗原性HA与NA的不同，又进一步分成不同亚型，分别以H1～ 可以通过变异成为H5N1，低致病性的H5N2也可以通过一系列的转变成为高致病 性的H5N2。 禽流感病毒的自然宿主是野生鸟类，特别值得说的是迁徙水禽，它们大多数是 通过粪便进行传播。07年，我们在上海东滩展开禽流感调查采样，检测得一株野生 绿翅鸭源禽流感病毒，并且是阳性样本，将样本带回P2实验室进行研究分析发现， 这是一株H5N2亚型的禽流感病毒(A／CommonTeal／Shanghai／1F／2007)。 通过设计特异性引物、PCR、克隆、测序之后，我们扩得了本毒株的HA、NA、 M、NP、NS基因的序列，我们对HA基因裂解位点附近氨基酸进行研究后发现， 它和低致病性的禽流感病毒氨基酸序列分子特征很一样，氨基酸序列是REARGLF。 制成基因遗传进化树，通过基因树可以看到，本株H5N2的HA基因与07年韩 国的aquatic 因与07年韩国的毒株aquatic 苷酸最相似。比对M基因、NP基因、NS基因的进化树可以看到，他们分别与韩国 bird／Korea／w1 bird／Korea／w22 的毒株aquatic 93／2007、aquatic 1／2007、aquatic bird依orea／w132／2006的亲缘关系最接近，他们之间的核苷酸最相似。 根据遗传进化分析可见，此次上海水鸟分离到的H5N2病毒株，与韩国06，07 年迁徙水鸟中分离的病毒株基因上来看最接近，而与中国内陆当下流行的家禽源病 毒株不接近，证明了此株H5N2毒株可能是由于东亚水鸟由于迁徙的关系传播到上 海来的，说明上海地区迁徙水鸟在禽流感感染、传播机制上、病毒遗传进化上来说， 都是相对独立的。 关键词：禽流感病毒，H5N2，野生鸟类，分子进化 ABSTRACT callbe and are Influenzavirus dividedinto A，B C．InfluenzaAviruses family type themost andmutativevirusesofthese widelyspread types．Avian Callbe and causedInfluenzaAvirusand transmittedinfected the by throughrespiratory other tothe tract,gastrointestinaltract，and ways．According many InfluenzaVmaesaledividedinto and highlypathogenic，lowpathogenic strains． Thevirusesarefurther tothedifferentcombinationsofHA subtype-edaccording isolatesCa