二甲烯丙基色氨酸合成酶的生物信息学分析.pdfVIP

第 54卷第 l3期 湖北 农 业科 学 Vo1．54No．13 2015年 7月 HubeiAgriculturalSciences Ju1．，2015 甲烯丙基色氨酸合成酶的生物信息学分析 二 蔡 壶，李朝晖，虞蔚岩 ，任源浩 (南京晓庄学 院生物化工与环境工程学院，南京 211171) 摘要 ：以二 甲烯丙基色氨酸合成酶 (DMArs)为研 究对 象，通过生物信 息学方法共检索到 37种微生物 中 的 77条 DMATs蛋 白质序列 使用MEGA v4．0软件构建 DMATS系统进化树发现 ．这些同源序列可分为 两大簇 ．在第一簇 中全为真菌的聚类 ．而第二簇 中是细菌和真菌的聚类 ，初步分析可能是 由于细菌和真 菌的进化速度不同或DMATS基 因是一个独立复制事件 。在进行DMATS的信号肽结构预测时发现．只有 Ajellomycescapsulata的DMATS (登录号：C6HC16)含有信号肽结构，由此可知，Ajellomycescapsulata (C6HC16)的DMATS可能是分泌蛋 白质 通过使用MEMEv4．9进行分析 ，最终得到了7条保守的motifs 序列．这些motifs可能对DMATS发挥功能具有重要作用。 关键词 ：二甲烯丙基色氨酸合成酶 (DMATS)；系统发育 ；motif；生物信息学 中图分类号：Q559 文献标识码 ：A 文章编号：0439—8114(2015)13—3273—06 DOI：IO．14088~．cnki．issn0439—8114．2015．13．053 BioinformaticsAnalysison DimethylallylTryptophan Synthase CAIYao，LIZhao-hui，YU W ei—yan，REN Yuan—hao (SchoolofBiochemicalandEnvironmentalEngineering，NanjingXiaozhuangUniversity，Naming211171，China) Abstract：Takingdimethylallyltryptophansynthetase (DMATS)proteinastheresearchobject，atotalof77DMATSprotein sequencesof37 kinds ofmicroorganism were retrieved by bioinformaticsmethods．The phylogeny analysis showed thatthese homologous sequencescould be divided into two clusters，one containing only fungi，and the othercontaining both bacteria and fungi，which may be the resultof different speed of evolution of bacterialand fungalor independentreplication of DMATSgenes．TheDMATSofAjellomycescapsulata (ID：C6HC16)wasfoundtocontainsignalpeptidebystructurepredic— tion．anditmaybeasecretedprotein inAjellomycescapsulata (ID：C6HC16)．Wefinallygotsevenconservedmotifse— quencesby MEME v4．9，whichmayhavean importantfunction in DMATS． Keywords：dimethylallyltryptophansynthetase (DMA