用image+j分析水稻胚乳淀粉粒表面几何特征的方法.pdfVIP

第 30卷 第4-5期 电 子 显 微 学 报 Vo1．3O．No．4—5 2011年 1O月 JournalofChineseElectronMicroscopySociety 2O11—10 文章编号 ：1000—6281(2011)04／05-0466-06 用 ImageJ分析水稻胚乳淀粉粒表面几何特征的方法 刘 智 ，王玲玲 ，周卫东 ，陈义芳 ，王 忠 (扬州大学 1．江苏省作物遗传生理重点实验室／农业部长江中下游作物生理生态与栽培重点开放 实验室， 2．测试 中心，江苏 扬州225009) 摘 要 ：以水稻淀粉粒光学显微镜和扫描 电子显微镜 图像为研究对象，介绍 了图像分析软件 ImageJ在淀粉粒表面 特征分析 中的应用。图像分析结果 以轮廓 图(outline)和拟合椭圆(ellipsefitting)两种方式呈现 ，分析指标选择 了面 积、周长、长轴、短轴 、圆度及最大切直径。最后还对颗粒图像的获取和图像前处理进行 了探讨。 关键词 ：ImageJ；水稻淀粉粒 ；显微 图像 ；图像分析 中图分类号 ：TP3l；S5Il；Q336；G115．215．3 文献标识码 ：A 小颗粒物质的表征性质是科学研究中经常需要 动对作物淀粉粒特性 的研究和为其他行业研究人员 测定的基本物理特征 ，其中包括单个颗粒的面积 、长 提供参考。 轴 、短轴 、周长、Feret直径和 圆度等 。此研究在化 1 材料和方法 工 、医药、食品与冶金等行业开展较多。随着计算机 软件技术的发展 ，该研究 已拓展到土壤学、园艺学、 1．1 供试材料 林业学、生物形态学和细胞生物学等研究领域 ，且研 供试材料为水稻 (oryzasativaL．)品种扬稻 6 究方法多种多样 ，其 中图像分析法以其操作简便、成 号2010年4～10月种植于扬州大学农学院试验田。 本低廉和科学性强 的优点，越来越受到重视而被应 取适量成熟籽粒制成精米 ，浸泡在蒸馏水中，置 用。如用 AutoCAD软件测定 园林植物 叶片面 于4℃冰箱2天 ，研钵充分研磨 ，过 4层纱布 ，然后 积 ，用 Matlab语言编制图像处理程序 ，开发出一 滤液分别过 100目、200目、300目和400目铜网筛。 套基于颗粒 图像 的颗粒粒度测量系统等 。国内 滤液在烧杯中静置 ，让淀粉在重力 的作用下 自由下 外使用 ImageJ软件进行此方面研究的也较多，有对 沉，然后去上清液，沉淀用适量蒸馏水悬浮，静置 ，去 碎屑状沉积物的粒度分布进行研究 ；对多孔高吸 上清 ，沉淀再悬浮。重复数次 ，直到上清呈无色透明 水性树脂的孔结构进行定量研究和对合成纤维成纸 状 。最后沉淀用无水乙醇悬浮 ，离心重新获得沉淀 ， 横截面 SEM 图像量化分析以及分析土壤结构特征 室温 自然干燥，干燥的淀粉研磨过 100目铜网筛，置 等 。近年来图像分析方法开始应用在植物学研 于干燥器中保存备用。 究领域。有研究人员曾用 PractiStat统计分析软件 1．2 水稻胚乳细胞透射电镜制样与观察 分析了小麦大 、小淀粉粒长轴和短轴 的大小分布范 花后2～20天取样 ，切成小块 ，放入 2．5％戊二 围、平均值和标准差 。但该软件普及程度不高 ， 醛 (GA)固定液 中，0～4oC固定 2d，磷酸缓冲液洗 且分析指标较少。 涤3次 ，1％四氧化锇 (OsO)室温后 固定3h。四氧 水稻是主要的粮食作物。其胚乳中的淀粉是 以 化锇 固定后 ，用上述缓冲液洗涤数次 ，酒精逐级脱 淀粉粒的形式贮存淀粉体 中，胚乳细胞的发育和充