《光皮桦BlSPL1转录因子基因的克隆、表达及单核苷酸多态性分析 Isolation, Expression and Single Nucleotide Polymorphisms Analysis of Transcription Factor (BlSPL1) from Betula luminifera》.pdfVIP
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《光皮桦BlSPL1转录因子基因的克隆、表达及单核苷酸多态性分析 Isolation, Expression and Single Nucleotide Polymorphisms Analysis of Transcription Factor (BlSPL1) from Betula luminifera》.pdf
第49卷第9期 林 业 科 学 VoL49.No.9
2Ol3年9月 SCIENTIASILVAESINICAE Ol3
Sep.,2
doi:10.11707/j.1001—7488
光皮桦曰2S兕J转录因子基因的克隆、
表达及单核苷酸多态性分析
李玉岭 周厚君 林二培 黄华宏 徐莉莉 童再康
(浙江农林大学林业与生物技术学院亚热带森林培育国家重点实验室培育基地临安311300)
like
摘要: Squamosapmmoterbindingproteingenes(s尸厶)对植物开花具有重要的调控作用。基于转录组序列并
825 170
利用RAcE技术从光皮桦中分离获得B£sP聪基因,其cDNA序列全长1
bp,包含开放阅读框长l bp,编码
389个氨基酸,与桃印sPL』(EM儿0405)的同源性最高(67%),属于陆地植物sPLs基因家族的groupV11分支。表
达分析显示口坶PLJ在光皮桦芽、雌花、雄花、幼苗中均有表达,在雄花和幼苗中表达量较低,但在芽发育成雌花过
程中明显上调,推测其可能对早期的雌花形成起调控作用。同时,从57个不同的光皮桦无性系中克隆B巧凡J的基
因组序列,进行单核苷酸多态性(sNP)分析,共检测到98个sNP位点,sNP频率为1/26
bp,多样性指数丌为
O.007
12。在外显子区域,共检测到28个sNP位点,其中11个为同义突变,17个为错义突变。进一步的连锁不平
衡分析显示,随着序列长度的增加,不同光皮桦群体Bfs凡J内的SNPs连锁不平衡在基因内部迅速衰退。
关键词:光皮桦;转录因子;SP£基因;单核苷酸多态性
中图分类号:S718.46 文献标识码:A 文章编号:100l一7488(2013)09一0052—10
and Nucleotide of
Isolation,ExpressionSingle PolymorphismsAnalysis
TranscriptionFactor(丑给PLJ)from曰Pm勋胁m切以朋
Li Zhou Lin XuLili
Yuling HoujunErpeiHuangHuahong Zaikang
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5c矗ooZ矿Fo阳st,y口厅d占曲衄c^加fogy,z^彬口ngA&F№西e玷i廿“n’D耳311300)
Abstract: like an rolein of
Squamosapromoterbindingproteingenes(JsP厶)pl
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