天花粉蛋白和马氏蝎毒分子的结构和功能预测.pdf

孓i1 66G1 №要嘶之 计算生物学是一门新兴的边缘学科，它的主要任务之一就是对未知的生物 学领域进行预测和根据给定的目标用计算机进行设计。随着计算机技术的飞速发 展，计算机实验改变了传统的理论和实验之间的关系。一方面，计算机模拟增强 了对模型准确性的要求，另一方面，模拟也可以和实验条件很相似，以致于计算 结果可以直接和实验结果相比较a 用分子动力学模拟和静电学计算研究天花粉蛋白在120—123位的定点突变 行为。结果揭示了在突变区附近静电特性和局域构象上明显的变化中提出了有关 突变的一个可能的物理学的解释。结果建议R122残基对120—123活性区是至关 重要的。正是定向的静电力导致底物与天花粉结合，静电场影响此对接过程的初 始导向。突变使活性丧失可主要归结于在天花粉活性沟区中此静电场方向性的丧 失。 用同源模建对马氏钳蝎中的一种新的a型昆虫神经毒素(BrnKo【ITl)的三 级结构进行了计算。 BmKcdTl与其受体间的相互作用估计是纯静电性的。