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摘 要
目的!本研究旨在将中国美利奴细毛羊基因组BAC文库分两级构建高质量的三维结构混合池,
同时设计一种高通量快速PCR筛选两级混合池的方法,为后续研究者从7.4万个克隆中快速筛选阳
性克隆,以用于绵羊基因组物理图谱的绘制和基因的图位克隆等研究,为其提供作图“试剂”和克隆
材料。
友洼!用等级混合法a血rarchical
pooling
维一级混合池和二级混合池,一级混合池基于每4个384-well盘而构建,由相同的行、列分别构建
行列的一级混合池,每盘各构建一个盘的一级混合池;将构建好的盘一级混合池(168个)以12列
×14行的方式排列,每行(或列)各构建盘的二级混合池,将行(或列)标号相同的一级混合池分
别混合成一个行(或列)的二级混合池。本研究中采用PCR方法筛选,采用一步筛选一个克隆或三
步筛选多个克隆的策略。第一步筛选盘、行和列的二级混合池,此时可以直接确定一个阳性克隆,
如果阳性克隆在两个以上,需采用三步筛选法,即阳性盘的确定和阳性盘中的阳性行、列的确定。
引物,用一步共66个PCR反应成功筛选到一个阳性克隆。用研究中设计的筛选方法筛选所构建的
混合池及
结途三-本研究所构建的混合池至少可满足300次PCR筛选所需。用本研究中设计的一步或三步
筛选策略可高效快速的筛选出大量阳性克隆,进而为绵羊基因组物理图谱的绘制和基因的图位克隆
等研究供作图“试剂”和克隆材料。
关键词:BAC文库,三维混合池,。高通量,筛选,绵羊
Abstract
of
aimofthis wastoconstructtwolevel basedthree·dimensionChinese
.Object:.The project pools
finewoolmerino BAC thesame a PCR
time,to
sheep library,at designhigh—throughputrapidscreening
methodtofindout clonesfrom ordertooffer and
positive 74,000BACs,in mappingreagentscloning
materialstothe and on
clongingsheepgenome.
physicalmappingmap-based
Method: thehierarchical constuctedtwolevels witha
strategies,we pools
Uesing pooling
schemeoftheBAC ofChinesefinewoolmerino
three-dimensional library sheep.Theprimary
pooling
rowandcolumnwerebasedonthesamerowandcolumnof four384-wellmicrotiter
pools every plates,the
werebasedonallclonesofeach384-wellmicrotiter
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