基于线粒体全基因组的五华三黄鸡系统发育分析.pdfVIP

第 33卷 第 8期 嘉应学院学报 (自然科学) V01．33 No．8 2015年 8月 JOURNALOFJIAYINGUNIVERSITY(NaturalScience) Aug．2015 基于线粒体全基因组的五华三黄鸡系统发育分析 黄勋和 ，陈洁波 ，李 婷 ，‘李威娜 ，罗海祥 ，陈换南 ，钟福生h (1．嘉应学院生命科学学院，广东 梅州 514015；2．梅州市畜牧兽医局，广东 梅州514000； 3．五华县天成三黄鸡种禽场，广东 梅州51,t431) 摘 要：AKGenBank下载72条原鸡属线粒体全基因序列，分别利用线粒体D—loop、13个蛋 白质编码基因及其氨 基酸序列构建系统发育树，揭示五华三黄鸡的分子进化．结果显示，基于D—loop的邻接树、蛋 白质编码基 因及其 氨基酸的最大简约树的拓扑结构高度一致，五华三黄鸡与中国云南及缅甸分布的家鸡与红原鸡亚种聚为一枝。而 与周边省份如江西省、湖南省、海南省几个鸡种的亲缘关系则较远，表明五华三黄鸡最有可能来源于中国云南． 关键词：五华三黄鸡；系统发生；线粒体全基因组；最大简约法；原鸡属 中图分类号：Q951+．3 文献标识码：A 文章编号：1006—642x(2015)08—0070—06 作为分布最广泛的家禽，家鸡(Callusg．domes— 等地，但后来逐渐受到改 良商品鸡 “石岐杂”、清远 tc／us)在人类生产生活中扮演着重要角色．而家鸡的 麻鸡、惠阳胡须鸡、广西三黄鸡、宁都黄鸡等大量引 驯化起源问题，自达尔文时代以来就一直备受学术 入的冲击，同时由于该鸡种生长速度慢、繁殖性能 界关注 ¨ J． 低，五华三黄鸡饲养数量急剧下降、品种特性受到 基因组包含着家养动物的起源与驯化历史信 严重侵蚀．近年来，课题组开展了五华三黄鸡资源 息 J．动物线粒体 DNA(MitochondrialDNA，mtD— 调查、生物学特性、品种选育、遗传多样性、分子进 NA)是共价闭合的环状双链DNA，其序列长度一般 化等研究，取得了一定的成果 引．黄勋和等 。分 在 l6—20kb左右 J．由于mtDNA基因组中结构简 析了五华三黄鸡线粒体控制区序列，表明该品种与 单、含量丰富、进化速率快、严格的母系遗传等特 中国红原鸡的亲缘关系最近．但由于线粒体控制区 点，被广泛用于动物群体遗传多样性、群体遗传结 固有的缺陷，如突变速率较高而引发的频发突变的 构、分子进化等研究 ．8“J． 特点会干扰家鸡mtDNA系统发育关系的构建，相对 五华三黄鸡是优 良的小型肉用地方品种，主要 有限的遗传信息不足以揭示家鸡驯化的更多历史 分布于广东省客家地区——梅州市五华县．长期独 细节 ． 特的生态环境条件形成了五华三黄鸡独特的 “三 因此，本文利用线粒体全基因的D—loop、蛋白 黄”特征，入选 《中国禽类遗传资源》¨引．上世纪八 质编码基因及对应的氨基酸残基数据系统分析五 十年代前五华三黄鸡一直是作为商品鸡出口香港 华三黄鸡在原鸡属的分类地位，揭示其品种起源， 为五华三黄鸡的保护与利用提供理论依据． 收稿 日期：0215—05—23 1 材料与方法 基金项目：广东省 自然科学基金项 目(2014A030307018)，嘉 1．1试验材料 ‘ 应学院 “创新强校工程”项 目(CQX019)；广东省级现代农业 产业发展建设专项(粤财农[2014]458号)；国家星火计划项