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微生物基础生物学 平台建设 / 研究任务 / 待扩展研究 概述 研究平台建设目标 计划中的研究任务 待扩展研究 作为本团队的基础建设部分，本方向参与创新团队开展研究工作所需的硬件基础设施、软件基础设施和应用技术平台建设，为福建省农业科学院微生物学研究提供技术平台支持和服务；并在微生物基础生物学如高效生防菌株筛选、功能基因克隆研究、微生物群落分析技术、细胞被膜、代谢途径、难培养微生物等领域开展相关研究。 微生物基础生物学平台建设目标 1) 生物农药行业特色微生物资源保藏中心 2) 微生物分类鉴定平台 3) 微生物生理研究平台 4) 微生物发酵工程技术研究平台 5) 微生物生态研究技术平台 6) 微生物功能基因研究平台 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 土壤标本库 从世界各地收集土壤标本。 土壤标本保存空间、保存设施 土壤标本采集、保存、取用标准操作程序 土壤标本入库、领用、废弃管理制度 土壤标本管理信息系统 收集保存至少3000份土样。 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 资源菌株采集体系 建立系列的标准操作程序，以此为指导从全国各地及土壤资源中收集微生物菌种资源，包括细菌、真菌、放线菌等，建立具有自主知识产权的新型农用微生物资源库。 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 资源菌株采集体系 工作目标 以制度建设、SOP文件作为提交材料，收集整理芽孢杆菌菌株，2006年收集100个菌株，2007年收集300个菌株，2008年收集800个菌株，与筛选平台相结合。购买大部分芽孢杆菌标准菌株。 标准程序 ? 土样采集标准，编号标准，保存标准。 ? 不同种类菌株的纯培养标准操作程序； ? 土壤中分离芽孢杆菌的标准操作程序； 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 资源菌株采集体系 结果 ? 系列的SOP文件 ? 分年度收集土壤样品清单 ? 分年度收集菌株清单 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 微生物菌株保存系统 建立生物农药菌株的硬件设施对菌株加以保存，并建立各种保存技术的标准操作程序(SOP)。建立多种菌株保藏机制，根据菌株保存的时间长短和应用需要加以选择，以冷冻干燥和超低温保藏为主。 设施 超低温冰箱/冰箱/冷柜/冷冻干燥机/应急电源。 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 微生物菌株保存系统 SOP ? 不同种类，不同保存方法的标准操作程序。 ? 菌株的存入SOP ? 菌株的取用SOP ? 菌株的复壮SOP ? 菌株的退出SOP ? 菌株的重入SOP 结果 库存菌株清单 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 信息管理系统 以团队拥有的菌株、土样标本等资源及相关研究为对象，采用计算机网络和数据库技术，构建基于Internet的菌种资源管理信息系统。为研究团队的动态管理提供方便，还能为有关科研工作及应用开发提供科学准确的资料，促进资源共享，提高研发效率。本信息系统可提供的服务为：菌株、研究结果等资源的管理、数据的备份、信息检索、查询。 1) 生物农药行业特色微生物资源收集与保藏中心 信息管理系统 　　土壤标本管理 　　微生物菌株管理 　　菌株共享平台 结果 ? 文章1-2篇，菌株和样品的标准编码程序SOP一个，使用说明书一份，网站演示材料一份 扩展 ? 软件登记一份。 2) 微生物分类鉴定平台 基于脂肪酸检测的生物农药菌株鉴定系统 采用美国MIDI公司研发并投入市场的MIS系统作为菌株的仪器鉴定手段。该系统鉴定结果可获得美国FDA认证许可，鉴定速度快。在大量测定数据的基础上，使用聚类方法建立一系列特色分类子库，如病害微生物--青枯雷尔氏菌的种下分类子库。 设施： MIS系统 SOP：参照使用说明书，外加测试中各种疑难问题的解答。 结果 ? 青枯雷尔氏菌等重要病害病原菌子库； ? 芽孢杆菌脂肪酸子数据库； 青枯雷尔氏菌脂肪酸子数据库。 2) 微生物分类鉴定平台 基于rDNA序列差异的生物农药菌株鉴定系统 本项目拟采用公用rDNA序列，通过拼接组装制作一个细菌 rDNA数据子库，建立网站，提供rDNA数据检索和比对功能，在此基础上构建一个鉴定系统。 设施：网站服务器 SOP:使用说明书 结果：网站 + 鉴定平台 +　若干子库研究 2) 微生物分类鉴定平台 基于传统生理生化方法的菌株鉴定系统 细菌传统鉴定法是细菌形态和生理生化水平的鉴定，依据细菌在多种标准培养基上生长的生理生化特性进行分类，是最经典、最常用的分类鉴定指标，也是现代化分类鉴定的依据。对于采用上述两种方案仍不能确定的菌株分类，拟采用传统的生理生化方法进行菌株鉴定。 设施与SOP均未定。 3) 微生物生理