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不同地区传统乳品中肠膜明串珠菌的多位点序列分型研究.pdf

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不同地区传统乳品中肠膜明串珠菌的多位点序列分型研究

摘 要 本研究通过选取分离自传统乳制品中的的136株肠膜明串珠菌(蒙古国14 株、四川I阿坝州30株、甘肃甘南州27株、内蒙古赤峰市28株、内蒙古锡林郭 勒盟22株、内蒙古呼伦贝尔盟15株)为研究对象,采用多位点序列分型方法对 的核苷酸序列进行分析,进而对肠膜明串珠菌的多态性分析和遗传进化展开研 究。对获取的持家基因的核苷酸序列进行双向测序,对其进行拼接、核对后绘出 等位基因图谱,确定了不同的序列型,排除基因突变和基因的重组交换。通过对 9个持家基因的G+C含量、dN/ds等分析得出,所选取的持家基因较为保守,可 以满足后续MLST分析。通过对其ST型进行分析,对136株肠膜明串珠菌进行 分型,得出如下结论: 余16个ST型为独特型。8个分型组各自为一个CC复合体,分别为CC55、 (2)136株肠膜明串珠菌之间的遗传进化关系,大部分与菌株分离地之间 的距离呈现正相关性。同时不同地区的分离株大部分是由分离自甘肃甘南州的菌 株进化而来的。 (3)来自甘肃甘南』一II_jfD四川阿坝州地区的菌株,他们聚集为一亚群,遗传 距离小,说明来自甘南州和阿坝州地区传统乳制品中肠膜明串珠菌的群体分化时 间较短。肠膜明串珠菌在不同地区传统乳制品的制作过程中,基因组在不断发生 变化,但也有些保守基因的变异被保存下来,形成自己独特的基因型特征。 关键词:传统发酵乳:肠膜明串株菌;多位点序列分型技术 MultilocusS ofLeuconostocmesenteroides equenceTyping fromTraditionalProductsin Dairy Different Regions Abstract This 136 study Leuconostocmesenteroidesisolatedfromtraditional investigate indifferent strainsfrom strainsfromAbain dairyproducts regions(14 Mongolia,30 strainsfromGannanin strainsfrom inInner Sichuan,27 Gansu,28 ChifengCity striansfromXilinGol inInner 5strainsfrom Mongolia,22 League Mongolia,1 HulunbeirinInner multilocus methodto League sequence Mongolia),using typing the ofnine analyze nucleotidesequenceshousekeepinggenes(anna,pyrG,pepN, the and rpoB,inurE,甜VrCmurC,groEL,pheS),thenstudyingpolymorphismgenetic evolutionofLeuconostocmesenteroides.Thenucleotideobtainedforthe sequence were inboth

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