利用ssr和四测序水稻品种构建分子图谱及qtls分析.pdfVIP

摘 要 大多数衣作物性状是由多基因控制的数量性状，对数量性状基因位点进行鉴定在作 物遗传育种上具有重要意义。尤其是用全基因组完成测序的材料进行数量性状的研究， 为进一步开展QTL功能解析奠定坚实的基础。本研究选用两个全基因组测序已经完成 分测序的光温敏两用不育系PA64S和完成了第4染色体全序列测序的籼稻广陆矮4号 进行了遗传连锁图谱的绘制，并对株高、抽穗期、千粒重等14类重要农艺性状进行了 QTL定位分析，其主要结果如下： 』 1．用756对水稻SSR引物在四个亲本材料间进行了多态性分析，结果表明：日本晴与 的多态性频率为11．24％。亲缘关系越近，两者之问的多态性越小。 并用SSR标记绘制了6张分子连锁图谱。在这6张图谱上定位的SSR标记数、覆 l】30．6，21．33。 3．由本实验室自行开发设计的SSR标记(编号为RP撑系列)，有90对被分别标定在上 1／GLA PA64S／GLA上有19对，NIPP／931l上有41对，NIPP／GLA上有46对，931 上有4对。 4．利用QTL区间作图法对株高、有效分蘖数、千粒重、抽穗期、穗数等14类水稻农 F2：3家系)，PA64S／Nipponbare—F2(包含其F2 个QTLs。在6个群体中所检测到的49个主效QTLs如下： ①在PA64S／9311-F2(包含其F2 3家系)群体中检测到的主效QTLs有7个：2个株 f 高QTLs 35．5％)。 粒重QTL(qkw2，29．5％)和1个株高QTL【qphl，32％)。 ⑤在NIPP／GLA—F 3个株 qpn2，23％)。 长QTL(qpll，20．4％)。 5．对本研究中检测到的QTLs位点进行了比较定位分析，结果表明：有许多控制不同 性状的QTLs被定位在相同的区间；另外包括抽穗期，分蘖数，有效分蘖数，穗长， 剑叶长，主穗长和株高等7类性状的14个QTLs位点被定位在不同群体的相同或相 邻的区间上。 的哪L分剐具有可能增加穗长和千粒重的作用，标记OSR28所连锁的QTL可能具 和RPl4各自连锁的QTL分别具有可能降低株高和减短剑叶长的作用；在群体 II 本研究还对株高性状的QTL进行了比较定位分析，以及SSR标记的偏分离、影响 QTL检测的各种因素和进行QTL基因克隆的可能性等方面进行了讨论。 关键词： 水稻 SSR遗传图谱QTLs生物信息学分析 11I of ConstructionSSR betweenFour Linkage Maps Sequenced Rice of Varietiesand TraitLoci Quantitative Mapping ZHANG Qijun ofAgronomy,SiehuanAgricultural (College ABSTRACT traitsare in Mostof