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哈克尼西棉细胞雄性不育系和保持系microrna研究
摘要
棉花细胞质雄性不育系在棉花杂种优势利用和棉花育种中具有重大作用和意义。目前由于棉
花基因组信息一直以来比较匮乏,细胞质雄性不育机理的研究还很少。miRNA作为真核生物基
因表达中的一类负调控因子,广泛存在于植物基因组中,对真核生物基因表达起非常重要的调控
作用,可以调控植物的生长发育、器官的形态建成、激素分泌、信号转导以及对外界环境胁迫的
应答能力等许多生物学过程。本研究利用solexa测序技术,对棉花细胞质雄性不育系和保持系花
粉母细胞时期的小花蕾进行miRNA测序,并通过靶基因预测功能分析,以期获得新的棉花
miRNAs和与不育相关的差异miRNAs及其靶基因,取得的主要实验结果如下:
712
823 462条,去除miRNAs序列中的冗余序列之后,获得
为9 976条,其中miRNAs序列为3
miRNAs序列为353
449
个miRNAs和53个候选棉花miRNA序列;保持系材料ZB获得的测序序列为11151条,其
中miRNAs序列为4450
候选棉花miRNA序列。通过测序,在两材料中共发现10个新的棉花miRNAs。
2.生物信息学分析和靶基因预测显示,这些miRNAs靶基因参与的植物生长发育过程主要有能
量代谢、物质代谢、生物或非生物环境胁迫应答、激素分泌、信号转导、器官和组织发育、转录
调控等。大部分通过靶定转录因子来调控各种生长发育过程。
4.差异表达miRNAs的靶基因预测结果包含一些与花发育和雄配子发育相关的转录因子,有
AUXINRESPONSE
BINDINGPROTEIN
SQUMOSAPROMOTER
霉素(Gibberellin)等。
Ttme
基因。通过Real RT-PCR分析,发现10个在两材料中存在明显差异表达,5个在不育系材
料ZBA中上调表达,5个在不育系材料ZBA中下调表达。
关键词:棉花miRNA,solexa测序,细胞质雄性不育,miRNA靶基因
Abstract
in heterosis
male has advantagesutilizing and
Cytoplasmicsterility(CMS)cottonsignificant
incottonis not becauseof
molecularmechanismofCMS still clear the
hybridization.Currently,the
fimitationofcotton information.miRNAsallextensiveclassof
genome represent endogenous
small rolesas factorsin
RNAs.Theyplayimportant negativeregulation gene
non-coding
of vitalrolesinthe
expressioneukaryoticorganisms.miRNAsplay generegulation
post-transcriptional
atvarious of as and secretion,
organogenesismorphogen
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