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棉属种间杂交渐系aflp和dna甲基化的遗传与变异
四川农业大学硕士论文
摘要
本研究利用AmplifiedFragmentLength
Sensitive
Amplified
份瑟亚海血缘渐渗系为材料,对棉属种间杂交渐渗系亲本、子代以及群体之间的染色
体和DNA甲基化模式变异进行探讨。结果如下:
1.对比克氏棉血缘渐渗系及其亲本进行AFLP分析,在总共得到的2000多个位
点中,总共3个位点显示为片段的丢失,8个位点显示新片段的出现。每个材料平均
有98%的片段直接来源于亲本,平均有11个片段可能直接来自于野生棉,说明渐渗
系中可能存在少量(少于0.8%)来自比克氏棉的位点。
2.利用比克氏棉血缘材料进行MSAP分析,3个渐渗系材料的总体甲基化水平
都和回交亲本比较接近(22.5%到22.7%)。对可能渗入的甲基化位点、发生变异的
位点(过甲基化位点和去甲基化)分析后发现,3个渐渗系材料之间的变异不是很明
显(变异位点在2.5%到3.5%之间)。结合AFLP的结果,表明3个材料中,中遗红
2无论在序列上还是DNA甲基化模式状态上都更接近陆地棉轮回亲本。
3.瑟亚海血缘渐渗系群体中渗入的各野生棉片段数量在各“渐渗世代”中也比
渗世代中渐渗位点分别为4、7、6、5个。无论从AFLP位点还是甲基化模式渗入位
点来看,这个渐渗群体中可能来自于海岛棉和瑟伯氏棉的片段要明显多于亚洲棉,
我们认为早世代材料(即“渐渗世代一”和“渐渗世代二)纤维品质在长度和比强
度上显著优于其他世代渐渗系材料可能就是受到海岛棉和瑟伯氏棉的影响。
4.通过同源比对分析部分甲基化变异的条带,发现发生变异的片段绝大部分都
和非编码序列和重复序列有关。
5.在瑟亚海血缘渐渗系群体中,通过AFLP和MSAP分析,两种方法均能有效
地将二倍体棉、海岛棉和渐渗系材料区分开来, MSAP结果更合理,将MSAP矩阵
拆分了以后发现甲基化敏感条带将各个材料能够很好地区分开来。因此,本实验结
果说明MSAP可以作为一种分析表观遗传多态性的可靠标记。
综上所述,棉属种间杂交渐渗系与亲本之间,DNA甲基化水平和模式在基本符
四川农业大学硕士论文
合孟德尔遗传规律的同时,也存在一定频率的表观遗传变异,且与AFLP遗传变异
趋势相似。与AFLP分析结果相比,MSAP分析棉属种间杂交渐渗系群体之间存在更
高的多态性,对渐渗系群体的亲缘关系分辨力更强,结合前人报告,进一步证明
MSAP可以作为一种可靠的表观遗传标记。
关键词:棉花;种间杂交渐渗系;AFLP,MSAP;表观遗传学
Ⅱ
四川农业大学硕士论文
andVariationofAFLPandDNA in
Inheritance Methylation
Cotton Lines
Introgressed
He Geneticsand
Shou—Pu(Crop Breeding)
DirectedProfessor
by FengZong—Yun
ProfessorDu
Xiong—Ming
Abstract
Theinheritanceandvariationof andDNA onthe
genome parents,
methylation
and
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