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深度测序数据表现和表换的全能格式及其编辑工具 中文摘要 深度测序数据表现和交换的全能格式及其编辑工具 中文摘要 随着下一代测序技术的飞速发展，产生了数以万计的数据，下游的分析软件也呈 指数增长。然而，这些软件之间的标准不统一，往往定义了自己的数据格式。因此， 在多个软件间进行数据交换就显得尤为困难。本文为解决这个难题，从两个层次逐步 深入。首先，开发出了一款界面友好，功能强大的数据格式转换软件。但是，数据格 式转换仍然存在诸多问题，如数据丢失，耗费时间等。接 ，本文提出了一种用于下 一代测序的通用数据格式NGSML。使用NGSML格式就可以解决大量数据间的交换 与显示问题，极大地方便研究人员将精力专注于所研究的核心问题上，而忽略数据格 式转换等繁琐的问题。同时，为了便于NGSML格式的操作，我们开发出了一款易于 使用的编辑软件，方便用户编辑和展示NGSML文件。最后，本文将NGSML格式应 用到了具体的问题中。在POMA软件的数据存储中使用了NGSML数据格式，展示 NGSML格式的强大功能和高度的可扩展性。 关键词：下一代测序，数据格式，格式转换 作 者：吴文涛 指导老师：沈百荣 I Aunifiedformatanditseditorforexchangeandpresentationdeepsequencingdata ABSTRACT Aunifiedformatanditseditorforexchangeand presentationdeepsequencingdata ABSTRACT With the rapid development of next generation sequencing, millions of data was produced and analysis software tools downstream were also growing exponentially. However,thestandardbetweenthesesoftwaretoolswasnotuniform.Thesesoftwaretools usuallydefinedtheirownformats.Itisdifficultytoexchangedatabetweenthese software tools. To solve this problem, we deal in two levels in this paper. First, we developed a friendly and powerful tool for format conversion. But format conversion still had some problemssuchasinformationlossandwasteoftime.Sothenwedevelopedausefulformat NGSML especially for NGS. It can solve data exchange and presentation problems. It would be great helpful forresearchers sothat researchers can focus ontheir core subject regardless oftroublesome formatproblems. Meanwhile,we developed aneasytousetool to edit and presentation of NGSML format. Finally, we applied NGSML into concrete problems. We stored data in NGSML format in POMA software. It showed its