!#引物设计及软件使用技巧研究论文.PDFVIP

生 物 信 息 学 "@*C<]0G’C<-0R4*0*CR0’)<D*EI 研 究论文 !"#引 物 设 计 及 软 件 使 用 技 巧 张新宇，高燕宁! （中国协和医科大学中国医学科学院肿瘤研究所，北京 $%%%&$） 摘要：介绍了使用软件设计 !"#引物的技巧。在 !"#引物设计原则的基础上，详细介绍了两种常用引物设计软件的基本 使用 方法，并对其各 自的优缺点进行了比较 。一般性引物 自动搜索可采用“!’()*(’!’*)(’+”软件，而引物的评价分析则可采用“,-*. /01”软件 。 关键词： ；引物设计；软件 !"# 中图分类号：2+&3文献标识码：4文章编 号：$15&6++1+（&%%3）6%36%%$+6%3 !"#$%&’()*+,-&.$-%/&0123&’"14(#)-&.$-)-$.&$-+ JKLMNO*C6G，NL,P<C6C*C/ （ ， ， ， ， ） !"#$%&’#()*)+)%!,*#%(%-$".%/0123%.*$"45$*%#$%(6%*7*#89:::;9!,*#" ： 56%0-4709@(IQ*--0R!"#S’*)(’T(I*/CU*D@I0RDU<’(*I*CD’0TGE(T*CD@*IS<S(’B4<I(T0CD@(S’*CE*S-(0R!"#6 ， ， ， S’*)(’T(I*/CD@(GI</(0RDU0Q*CTI0RS0SG-<’S’*)(’6T(I*/CI0RDU<’(U<I’(V*(U(TT(D<*-(T-*CE-GT*C/D@(*’)(’*D T()(’*D<CTGI</(IQ*--IBWD*I’(E0))(CT(TD0GI(!’()*(’!’*)(’+R0’D@(GIG<-<GD0)<D*ES’*)(’II(<’E@，HGD,-*/01 S’*)(’I<C<-I*IB ： ； ； ； 8$9/"-#%!"#S’*)(’T(I*/CGI</(IQ*--I0RDU<’( 自从 $8:+年 X<’CYG--*I发 明了聚合酶链式反应 具体实现 这 7条基 本原则需 要考虑 到诸 多因 （ ）以来， 技术 已成为分子生物学研 究中使用 素，如 引物 长 度 （ ），产物 长 度 （ !"#!"# S’*)(’-(C/D@S’0TGED ［$］ 最多、最广泛的手段之一 ，而引物设计是 技术 ），序列 值（ ），引物与模板 !"#-(C/D@9))(-D*C/D()S(’<DG’( 中至关重要的一环。使用不合适 的 引物容易导 形成双链 的内部稳定性（ ，用 值反 !"# *CD(’C<-ID<H*-*DN ! 致实验失败 ：表现为扩增 出 目的带之外的多条带（如 映），形成 引物二聚体（ ）及发夹结构（ S’*)(’T*)(’TG. 形成引物二聚体带 ），不出带或出带很弱，等等。 ）的能 值，在错配 位 点（ S-(=R0’)<D*0C<CT@<*’S*CR<-I( 现在 引物设计大都通过计算机软件进行。