Tracking character evolution and biogeographic history through time in Cornaceac ——Does choice of methods matter？.pdfVIP

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2016-02-08 发布于北京
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维普资讯 JournalofSystematicsandEvolution 46(3)：349—374 (2008) doi：10．3724／SP．J．1002．2008．08056 (formerlyActaPhytotaxonomicaSiniea) http：Hwww．plnatsystematics．COITI Trackingcharacterevolutionandbiogeographichistorythroughtime inCornacea —Doeschoiceofmethodsmatter? Qiu．Yun(Jenny)XIANG ‘DavidT．THOMAS (DepartmentofPlantBiology,NorthCarolinaStateUniversity,RaMgh，NC27695，USA) Abstract Thisstudycomparesresultsonreconstructingtheancestralstateofchraactersandancesrtalraeasof distributioninCornaceaetogaininsightsintotheimpactofusingdifferentnaalyticalmethods．Ancesrtalchraac． tersattereconstructionswerecompraedamongthreemethods(prasimony，maximum likelihood．nadstochastic chraactermapping)usingMESQUITEnadafu11Bayesina methodinBAYESTRAITSnadniferencesofnacesrtalraea distributionwerecomparedbetweentheprasimony．baseddispersa1．vicarinacenaalysisrDIVA)nadanewly developedmaximum likelihoodrML)method．Resultsnidicatedthatamongthesixinflorescencenadfruitchra． actersexamined，p‘‘erfect’bniarychraacters(nohomoplasy，nopolymorphismwithinterminals．nadnomissing daat)raelittleaffectedbychoiceofmethod，whilehomoplasiouscharactersandmissingadatraesensitiveto methodsused．Ances仃alraeasatdeepnodesofthephylogenyraesubstantiallydifferentbewt eenDIVA na dML and strikinglydifferentbewt een na alysesnicludingna dexcludnigfossilsat threedeepestnodes．Theseresults． whileraisingcautionni maknigconclusionsonrtaitevolutionandhistoricalbiogeographyusingconventional methods．demonsrtatealimi tation inourcurrentunderstandingofchraacterevolutionnadbiogeography．Th e biogeographichistoryfavoredbytheML naalysesincludnigfossilssuggestedtheorigni naderalyradiationof ComuslikelyoccurrednithelateCretaceousnaderaliestTertiary inEuropenadintercontnient