广西黄鸡β-防御素基因的克隆、序列分析与组织分布.pdfVIP

维普资讯 第29卷 第3期 华南农业大学学报 Vo1．29，No．3 2008年 7月 JournalofSouthChinaAgriculturalUniversity JIl1．2008 广西黄鸡 ／3一防御素基因的克隆、 序列分析与组织分布 冀 君，陈燕珊，张祥斌，陈俊伟，马静云，毕英佐，谢青梅 (华南农业大学动物科学学院，广东广州510642) 摘要：用设计的特异性引物 ，采用RT．PCR方法扩增到广西黄鸡 B|一防御素基因gallinacin一1(简称Gal一1)～gallinacin一 13(简称 Gal一13)．通过克隆、测序获得这 13个基因的cDNA核苷酸序列，并提交到GenBank(Gal一1一Gal一13基因的 注册号为：DQ858297～DQ858310)．比较分析广西黄鸡 13种 防御素Gal一1～Gal一13基因分别与GenBank中注册 的防御素基因氨基酸序列的相似性，其氨基酸的相似性均在95．5％～100％之间．利用DNAStar软件对所获得的 13种广西黄鸡JB一防御素基因进行系统发育树分析，结果Gal一1与Gal-5、Gal一12、Gal-2在同一分支上，Gal一6、Gal-7、 Gal-9、Gal-8在同一分支上，Gal一10、Gal一11、Gal4在同一分支，Gal一13独自为一分支．同样用 RT—PCR方法分析了广 西黄鸡 防御素Gal一1～Gal一13基因在不同组织中的分布，结果发现：Gal一1、Gal-2、Gal-4、Gal一5、Gal-6、Gal-7、Gal一10 的表达分布非常广泛，Gal-3、Gal一8、Gal-9、Gal一11、Gal一12、Gal一13的分布较少． 关键词：广西黄鸡 ；JB一防御素；gallinacin基因；序列分析；组织分布 中图分类号：$859．796 文献标识码：A 文章编号：1001—411X(2008)03—0061—05 Cloning，SequencingandTissueDistributionofflD·efensin GallinacinGenesinGuangxiYellow Chicken JIJun，CHENYan—shan，ZHANGXiang—bin，CHENJun—wei，MAJing—yun，BIYing—ZUO，XIEQing—mei (CollegeofAnimalScience，SouthChinaAgriculturalUniversity，Guangzhou510642，China) Abstract：Withspecificprimers，thirteenchickenjB—defensingallinacin—l(Gal—1)一gallinacin一13(Gal— l3)cDNAfragments，wereamplifiedbyreversetranscription—polymerasechainreaction(RT—PCR)from GuangxiYeHow chicken．AllofthecDNA fragments coveredhtefull—length ofhteopen readingframe， wiht theexceptionofGal-3．Afterbeingsequenced，13cDNA rfagmentswereidentifiedanddepositedto GenBankMT(accessionnumbersDQ858297一DQ858310)．I’}Ieresultsofsequencecomparisonwihthte 8一defensingenesequenc