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正常猪外周血淋细胞cdna文库部分est序列的电子克隆及初步实验验证
广西大学硕士论文 正常猪外_I爿血淋巴细胞部分ESTs序列的电子克隆及初步实验验证
正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库部分EST序列的电子克隆及初步
实验验证
摘要
近来,通过电子克隆而获得的猪新基因多与猪的毛色、脂肪代谢、肉
质、生殖机能等重要经济性状相关,而与猪体先天性及特异性免疫反应相
关的基因鲜有报道,本研究拟探寻利用生物数据库进行电子克隆获得部分
乃至全长基因的方法,试图快速克隆出影晌病毒复制及抗病毒免疫相关的
猪新基因。
本研究对来自正常猪外周血淋巴细胞cDNA文库测序所得的部分EST序
进行了基因注释,证实它们均得到了有效延伸,具有完整开放阅读框,其
中已知的猪基因序列14条,猪新基因序列6条,分别从已知猪基因序列和
未知猪基因序列中各抽取一条感兴趣序列进行全长cDNA的预测,它们的编
号分别为ESTconti9110和EST
conti9133,设计特异引物对两条候选序
列进行克隆与测序,结果与电子克隆所得序列一致,证实了电子克隆的有
效性。本研究还对猪的新基因——60s核糖体蛋白L18a亚基作了蛋白质基
本理化性质、疏水性和二级结构的初步预测。人的这个蛋白与丙型肝炎病
毒mRNA上的内部核糖体入口序列产生相互作用,在病毒蛋白的正确翻译过
讵常猪外周m淋巴细胞部分ESTs序列的电子克隆及初步实验验证
程中起重要作用,具有重要研究价值。
关键词 电子克隆 表达序列标签(EST)猪外周血淋巴细胞
核糖体蛋白
£堕查堂堡主堡壅 巫堕堕!!堡垒塑里型望墅坌堕曼堡型塑鱼王塞堕墨塑生壅墼壁竺
INSILICOCLONINGPARTIALESTSFROMCDNALIBRARY
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IDENTIFICATION
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