cDNA芯片筛选亚洲棉短绒分化发育相关基因.pdfVIP

中国农业科学 2010,43(2):430-437 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2010.02.026 cDNA芯片筛选亚洲棉短绒分化发育相关基因 赵国红，王 晟，贾银华，孙君灵，王 杰，杜雄明 （中国农业科学院棉花研究所/农业部棉花遗传改良重点开放实验室，河南安阳 455000 ） 摘要：【目的】筛选亚洲棉短绒分化发育相关基因。【方法】利用 cDNA 芯片技术在棉纤维发育前期开花前 3 天(-3DPA)、开花当天(0DPA)、开花后 3 天(+3DPA)、5 天(+5DPA)、7 天(+7DPA)筛选野生型 DPL971 与其短绒突变 体 DPL972 的差异基因。通过与模式植物拟南芥数据库相结合，找到与棉纤维起始发育相关基因，并通过 RT-PCR 和 Real-Time PCR（QRT-PCR）验证部分侯选基因。【结果】筛选出与亚洲棉纤维起始分化发育相关基因 8 个，其 中相对应的与拟南芥同源性较高的蛋白有7个，分别为KAK（DR461366）、MYB5（ES812048）、TTG1（ES811600）、 MYB23（DR453866）、CSLD3（DR459646）、RHD2（DR461821）和ZWI（ES791383）,这些基因在拟南芥的表皮毛起始 发育过程中都起着重要的作用。RT-PCR 和 QRT-PCR 结果表明 MYB23、MYB5、TTG1、CSLD3、RHD2 这 5 个基因在短 绒突变体DPL972与其野生型DPL971的+3DPA 胚珠中表达差异都有差异。【结论】上述结果表明这5个基因可能与 短绒分化发育相关，第1个基因可能抑制短绒分化和发育，后4个则促进短绒分化和发育。 关键词：亚洲棉；cDNA芯片；棉纤维；光籽 Genes Related to Fuzz Initiation and Development in Gossypium arboretum Identified by cDNA Microarray ZHAO Guo-hong, WANG Sheng, JIA Yin-hua, SUN Jun-ling, WANG Jie, DU Xiong-ming (Cotton Research Institute, Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory for Cotton Genetic Improvement, Ministry of Agriculture, Anyang 455000, Henan) Abstract: 【Objective 】 The objective of this study is to isolate genes related to fuzz initiation and development in Gossypium arboretum. 【Method 】 The filter arrays of cDNAs were performed to identify the differentiation expressed genes between the wild-type DPL971 and its fuzz mutant line DPL972 in the early developing stages of -3DPA, 0DPA, +3DPA, +5DPA, and +7DPA. Compared with the database of model plant Arabodopsis thaliana , some genes related to the initiation of the cotton fiber w