基于Meta分析的大豆百粒重的QTLs定位.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(11):3795-3803 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.11.005 基于Meta分析的大豆百粒重的QTLs定位 1 1 3 3 1，2 2 1 齐照明 ，孙亚男 ，陈立君 ，郭 强 ，刘春燕 ，胡国华 ，陈庆山 1 2 3 （东北农业大学农学院，哈尔滨 150030 ； 黑龙江省农垦科研育种中心，哈尔滨 150090 ； 黑龙江省农业科学院作物育种研究所，哈尔滨 150086 ） 摘要：【目的】百粒重是控制大豆产量性状的主要数量性状，对大豆产量性状进行基因定位具有重要的研究 和应用价值。现有百粒重 QTL 定位结果分散，需选择合适的公共图谱，整合前人的研究结果，使其真正应用到实 践中。【方法】以2004年发布大豆公共遗传连锁图谱soymap2为参考图谱，将近20年不同试验中的大豆百粒重的 QTLs 进行映射整合，构建百粒重 QTL 综合图谱。利用 BioMercator2.1 的映射功能将国内外常用的大豆图谱上的 百粒重 QTLs 通过公共标记映射整合到大豆公共遗传连锁图谱 soymap2 上，并利用 Meta 分析，通过对比已经报道 的 QTLs 的 95%的置信区间来推断 QTL 位置，从而提取真正有效的 QTL 标记。【结果】在已经发表的文献中共找到 65 个百粒重 QTLs 定位信息，其中有 53 个 QTLs 定位区间与公共图谱有共有标记，包括 36 个增效效应的 QTLs 和 17个减效效应的百粒重QTLs，共得到12个 QTL簇，通过Meta分析，发掘出6个增效效应和6个减效效应的百粒 重“通用 QTLs”及其连锁标记。【结论】本研究得到的“通用 QTLs”其置信区间最小可达到 1.52 cM，为辅助选 择分子标记、QTL精细定位以及数量性状基因的克隆奠定基础。 关键词：大豆；百粒重；Meta分析；通用QTL；MAS Meta-Analysis of 100-Seed Weight QTLs in Soybean 1 1 3 3 1,2 2 1 QI Zhao-ming , SUN Ya-nan , CHEN Li-jun , GUO Qiang , LIU Chun-yan , HU Guo-hua , CHEN Qing-shan 1 2 ( College of Agronomy, Northeast Agricultural University, Harbin 150030 ; The Crop Research and Breeding Center of Land-Reclamation, Harbin 150090 ; 3 Crop Breeding Institute, Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150086) Abstract: 【Objective 】 Soybean is a major crop in the world, and the yield is a very important trait. 100-seed weight is a v