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第 1 篇 生物分子的结构和化学 我们所处在的地球充满着无数的生物,从最简单的病 毒、类病毒到菌藻树草,从鱼虫鸟兽到最复杂的人类,处 处都可以发现它们的踪迹,觉察到生命的活动。地球上的 生物形形色色,千姿百态。不同的生物,其形态、生理特 征和对环境的适应能力各不相同,都经历着生长、发育、 衰老、死亡的变化,都具有繁殖后代的能力。 一、生命物质的化学组成 自然界所有的生命物体都由三类物质组成:水、无机离子和生物分子。 生 物 分 子 泛指构成生物的蛋白质、核酸、多糖、脂质以及它们的构件分子和代谢中间物等。 生物分子基本特征 1.生物分子是碳的化合物 2. 生物大分子及其构件 生物分子中最重要的蛋白质、糖和核酸几类物质,分子量一般都很大,所以又称为生物大分子。 构件 (构件分子、单体) 蛋白质: 核酸: 多糖: 二、生物分子的三维结构 立体异构与构型 几个重要概念 3、旋光度 构成生物大分子的结构单元分子大多数都是手性分子。例如,构成蛋白质的氨基酸都是 L-型,构成多糖的葡萄糖都是 D-型。 8. 立体异构体:具有相同的结构式,但原子在空间的排列方向不同而引起的异构体。 生物分子间相互作用的立体专一性 外消旋物 立体异构专一性 (1)旋光异构专一性:L-氨基酸氧化酶只能催化L-氨基酸氧化,而对D-氨基酸无作用。 (2)几何异构专一性: 反丁烯二酸水化酶只催化反丁烯二酸生成苹果酸 构象与三维结构 构象:在有机化合物分子中,由于分子中C—C单键自由旋转而形成的原子或基团在空间排列的多种形态称为构象。构象的改变是由于单键的旋转而产生的, 不需有共价键的变化(断裂或形成), 但涉及到氢键等次级键的改变。 三、生物结构中的非共价力 a.静电相互作用(也称离子键、盐键或盐桥):是生物分子中带有正、负电荷的基团之间的一种相互作用。 b. 氢键:与电负性大的原子X(氟、氯、氧、氮等)共价结合的氢,如与电负性大的原子Y(与X相同的也可以)接近,在X与Y之间以氢为媒介,生成X-H…Y形式的键。这种键称为氢键。 c. 范德华力: 极性分子间及极性基团间作用力,比氢键和离子键都弱。 d. 疏水相互作用:是指在介质水中的疏水基团倾向于聚集在一起,以避开与水的接触。球状蛋白质中的疏水残基(非极性)有一种自然的避开水相互相聚集在分子内部的趋势,这种现象称为疏水相互作用。它在维持生物大分子的三维结构方面占有突出的地位。 * * 第1章 生物分子导论 1、偏振光 光是一种电磁波,光振动的方向与它前进的方向垂直。普通光由不同波长的光组成,这些不同波长的光在无数个垂直于其传播路线的平面内振动。 当普通光通过尼可尔(Nicol)棱镜时,只有振动方向和棱镜晶轴平行的光才能通过,所得到的光就只在一个平面上振动。这种只在某一平面上振动的光叫做平面偏振光,简称偏振光。 (a)普通光 普通光 尼可尔棱镜 偏振光 (b)偏振光的产生 2.旋光性:物质能使偏振光的振动平面发生旋转的性质。 具有旋光性的物质叫做旋光性物质。 如乳酸、甘油醛、葡萄糖等。而水、乙 醇、乙酸等称非旋光性物质。 偏振光 旋光性物质 旋转后的偏振光 当偏振光通过某一旋光性物质时,其振动平面会向着某一方向旋转一定的角度,这一角度叫做旋光度,通常用“α”表示。 光源 起偏镜 偏振光 盛液管 旋转后的 检偏镜 通过检偏镜 偏振光 的偏振光 在盛液管中放入旋光性物质后,偏振光将发生偏转。使偏振光振动平面按逆时针方向旋转的物质称左旋体,用“-” 表示;使偏振光振动平面按顺时针方向旋转的物质称右旋体,用“+” 表示。 肌肉分解出来的乳酸是右旋体,称为右旋乳酸。可表示为:(+)-2-羟基丙酸。 比旋光度公式如下: α: 测得的旋光度; c: 质量浓度,g/ml; l: 盛液管的长度,dm; t: 测定时的温度; λ: 光源的波长. 通常用比旋光度[α]来表示物质的旋光属性。 4、比旋光度 在一定条件下,某物质的旋光性为一常数,称为比旋光度。 任何物体都有它的镜像。一个有机分子在镜子内也会出现相应的镜像。实物与镜像相应部位与镜面具有相等的距离。实物与镜像的关系叫对映关系。 5、 手性分子 化合物分
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