黄河三角洲表层积物古菌分布特征.pdf

摘 要 目的：研究黄河三角洲近海岸区域古菌的多样性及分布。方法：以 PCR 技术为 基础构建古菌 16S rDNA 基因文库，在小尺度上选择 6 个不同站位的沉积物样品进 行研究。结果：1. 经研究处理后共获得了 568 个克隆，扩增所得的 16S rRNA 基因 经过限制性双酶切分析及应用软件 DOTUR 进行 97% cut off 后共得到 73 个有效操 作分类单元（Operational Taxonomic Unit ,OUTs）。2. 所有阳性克隆经双酶切后 进行测序，通过网上进行序列比对通过传统统计学方法及所获基因构建系统发育树。 3. 对实验获得的 16S rDNA 分析发现，本 次研究的古菌均来自泉 生 古菌 （Crenarchaeota ）和广生 古 菌 （Euryarchaeota ）两大类。 其中， Marine Crenarchaeotic Group I(MG- I) （88.8% ） 占据了主要地位 ，接下来依次为 Miscellaneous Crenarchaeotic Group （MCG）；DSAG （Deep-Sea Archaeal Group） 也称为 MBG-B；MBG-D，也称 MG-III （Marine Group III）以及、TMEG （Terrestrial Miscellaneous Eurarchaeotal Goup）。结论：结果反映，MG-I 与 MCG 这两个古菌 类群的克隆数占 16SrDNA 总克隆数的 96%，两者均是海洋中最为常见的古菌类群， 这也符合近海环境较为稳定的特点。近海沉积物中古菌群落结构在水平范围并没有 显著的变化，只是随着相对海岸距离的不断拉大，古菌类群多样性相应变高。另从 地域分析，本次研究古菌的同源序列多来自于江河流域的沉积物，部分古菌反映了 该区域可能存在的甲烷厌氧氧化的区域特征，从而间接揭示了古菌的群落结构特征 应该与近海海域的特点及其周边环境有着较大的关联，其群落结构的分布和多样性 也可以作为海洋环境的一个重要指示，以利于后续微生物领域的研究。 关键词：黄河三角洲；古菌；多样性；水平分布 Diversity of Achaea Communities in Surface Sediments Located at Yellow River Delta Abstract OBJECTIVE:To investigate the distribution and diversity of archaea in the Yellow River Delta coastal mud wedge of yellow Sea. METHODS:To construct archaeal 16S rDNA genes sequences by using PCR cloning approach. RESULT: 1. A total of 568 archaeal 16S rDNA clones were examined and a total of 73 OTUs (Operational Taxonomic Unit s， OTUs) were obtained after restriction enzyme digestion analysis and 97%cut-off. 2. Each representative sample was sequenced and blasted,molecular phylogenetic and statistic analysis. 3.archaeal 16S rDNA gene sequences were grouped into phylums of Crenarchaeota and Euryarchaeota,respectively. The important role of archaeal phylotypes was Marine Crenarchaeotic Group I(MG- I) （88.8% ），additional few sequences fell int