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应用rapd技进行白榆种群遗传多样性研究
摘 要
本研究以科尔沁沙地和浑善达克沙地的 6 个天然白榆种群为研究对象,采用 RAPD
分子标记技术,在 DNA 水平上对天然白榆的遗传多样性进行分析研究,揭示内蒙古自
治区榆树的遗传变异状况,从而为榆树遗传资源的科学保护、利用和遗传改良提供科
学依据,以最大限度的保护与开发利用内蒙古自治区丰富的榆树遗传资源。
通过对天然白榆 RAPD 反应体系的随机引物浓度、模板 DNA 用量、dNTP 浓度、Taq
2+
DNA 聚合酶浓度和 Mg 浓度等进行梯度试验,建立了适合白榆 RAPD 扩增的最佳反应体
系:TaqDNA 聚合酶 1U,dNTP 0.2mM,Mg2+ 2.0mM,引物 1mM,1³Buffer2.5μL,模
板 DNA 30ng,总体积 25μL 反应体积。扩增程序:94℃预变性 3min;94℃变性 1.0min,
37℃退火 1.5min,72℃延伸 1.5min,40 个循环;72℃延伸 5min。
从 35 条引物中筛选出扩增多态性较多且扩增产物稳定的 RAPD 引物 17 条。对 6
个白榆种群的 180个叶片样品的基因组 DNA 进行扩增,共检测到 181 个位点,多态位
点有 96 个,多态位点百分比为 52.89%。
天然白榆的不同种群内的遗传多样性水平差异不大,6 个白榆种群的 Neis 多样
性指数(h)和Shannons 多样性指数(I)介于0.1918~0.2999 和 0.2873~0.4366。
Neis 多样性指数(h)和Shannons 多样性指数(I)的统计结果均显示白榆的遗传
多样性主要存在于种群内。
6 个天然白榆间的遗传分化系数 Gst 为 0.3768,即种群间的遗传变异所占比例为
37.68%,种群内的遗传变异所占比例为 62.32%。科尔沁沙地 3 个白榆种群的遗传
分化系数 Gst 为 0.3398,浑善达克沙地 3 个白榆种群的遗传分化系数 Gst 为 0.3142。
遗传分化系数表明科尔沁沙地白榆种群间遗传分化相对于浑善达克沙地白榆种群间
遗传分化比较明显,且两地白榆各种群间的主要遗传变异均来自于在种群内;科尔沁
沙地白榆种群间基因流 Nm=0.9716 小于 1,表明种群间基因交流水平较低;浑善达
克沙地白榆种群间基因流 Nm=1.0914 大于 1,表明种群间基因交流水平较高。
6 个种群的遗传距离显示,在浑善达克沙地种群间,白音塔拉种群与那岱庙种群
之间遗传距离最大,达到 0.4081,宝绍岱种群和那岱庙种群之间遗传距离最小,为
0.2482。6 个种群明显聚为两类,那岱庙种群和宝绍岱种群聚为一类;白音塔拉、乌
丹林场、乌苏吐保护区 3 个种群聚和高格斯台种群聚为一类,最终两大类聚在一起。
科尔沁沙地和浑善达克沙地白榆各种群间的遗传距离不明显。
基于以上研究结果,从白榆种群遗传改良种群遗传多样性保护两方面提出了相应
的资源利用和保护策略。
关键词:白榆;遗传多样性;RAPD;保护
Study on Genetic Diversity among Different Populations of Ulmus
p umila Using RAPD Method
Abstract
The genetic diversity and genetic structure of six Ulmus pumila populations in
Keerqin sandland and Hunshandak sandland were assessed by using RAPD markers.
Keerqin sandland and Hunshandak sandland limit of natural Ulmus pumila important
genetic diversity status analysis, reveals the Inner Mongolia autonomous region Ulmus
pumila , as well
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