应用碱基淬灭探法检测α-1抗胰蛋白酶基因342glu→lys突变.pdfVIP

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应用碱基淬灭探法检测α-1抗胰蛋白酶基因342glu→lys突变

应用碱基淬灭探针法检测 -1 抗胰蛋白酶基因 342Glu→Lys 突变 中文摘要 应用碱基淬灭探针法检测α-1 抗胰蛋白酶基因 342Glu→Lys 突变 中文摘要 目的:利用碱基淬灭探针技术建立检测编码α-1 抗胰蛋白酶基因 342Glu→Lys 突 变位点的新型诊断方法。 方法:(1)方法学构建:引物、探针设计,探针 3 端标记 6-羧基荧光素,同时 构建 2 个载体作为阳性对照模板,分别代表两种可能的纯合子基因型,即野生型 (342Glu/Glu )和纯合突变型(342Lys/Lys )。收集338 例病人全血标本,离心柱法抽 提基因组 DNA ,PCR 扩增目的产物,应用熔解曲线对结果进行分析判断。(2 )方法 学优化:优化 PCR 反应条件并检测方法的准确性和灵敏性。 结果:熔解曲线分析结果显示纯合突变型(342Lys/Lys )和野生型(342Glu/Glu ) 分别在 41.38±0.90°C 及 48.64±1.33°C 处出现单一熔解谷;人工构建的杂合子(342Glu/ Lys )在 41.38±0.90°C 及 48.64±1.33°C 处均出现熔解谷。338 例病人标本均在 48.64±1.33°C 处出现熔解谷,与野生型阳性对照结果一致,即所有标本基因型均为 3 342Glu/Glu 。灵敏性分析结果显示模板 DNA 量在 10 拷贝时也可以看到明显的熔解 谷。Kappa 检验显示该方法的检测结果与 DNA 测序法所得结果完全一致(K=1 , P=0.000 )。 结论:本研究所建立的方法准确、简单、经济,适合大规模对α-1 抗胰蛋白酶基 因 342Glu→Lys 突变的分型诊断。 关键词:单核苷酸多态性; α-1 抗胰蛋白酶缺陷病; PiZ 型突变 作 者:秦 莉 指导老师:罗光华 I Abstract Detecting alpha-1 antitrypsin gene mutation of 342Glu→Lys using a base-quenched probe Detecting alpha-1 antitrypsin gene mutation of 342Glu→Lys using a base-quenched probe Abstract Objective: We developed a new method of the base-quenched probe technique to detect a mutation of the alpha1-antitrypsin gene, consisting of the substitution of lysine for glutamate at 342(Glu342Lys). Methods: (1). Methodology: according to the principles of probe design, 6-carboxyfluorescent was directly conjugated to the 3end of the probe. Two vectors, representing the two genotypes, wild type (342Glu/Glu) and

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