中国汉族人群散性帕金森病易感基因gak、flj43860、cd38、c18orf1、prdm2、wnt9a外显子的高通量测序分析.pdfVIP

摘要 摘要 Parkinson’S 目的：对散发性帕金森病(Sporadic disease，SPD)患者易感基因 序，寻找与SPD发病相关的碱基突变。 方法：收集对照组50例，病例组50例，分析患者临床资料，抽取外周静脉 血，提取DNA，行DNA浓度与光密度测定，设计易感基因外显子引物，合成 引物，扩增易感基因外显子序列，高通量测序，数据结果分析，筛查病例组和 对照组中微小突变(SNPs、微小缺失和微小插入)以及大片段的缺失／重复突 变。病例组和对照组测序结果进行卡方检验，筛选出P0．05的突变位点，将筛 选出的突变位点进行SIFT分析及LOF分析。 结果：①临床资料分析显示，病例组平均发病年龄(58．6+10．5)岁，40岁以 前和80岁以后发病少见，男女发病比例1．1：l；对照组平均年龄(59．1+11．3) 岁，男女比例1．6：1；②测序发现病例组有37197个碱基突变位点，对照组有 29780个碱基突变位点；③病例组和对照组测序发现的碱基突变位点进行卡方 SIFT分析发现1888个位点中有64个可能对PD发病有危害，均为非同义突 个。 结论：SPD以中老年发病为主，男性居多，以静止性震颤、肌强直、运动迟缓 和姿势步态异常为主要临床特点。外显子高通量测序筛查出GAK、FLJ43860、 析发现64个位点突变可能对SPD发病有影响，LOF分析发现了236个非同义 突变位点，但须进一步大样本验证分析。 关键词：中国汉族；散发性帕金森病；高通量测序；突变位点：SIFT分析 Abstract ABSTRACT findthemutationsof which Objective：To bases berelationtoSPD。wetake may ofcandidateGAK、FLJ43860、CD38、 high-throughput sequencing genes C180rfl、PRDM2、WNT9aexonfor Parkinson’Sina Han sporadic diseaseChinese population。 Methods：Theclinicaldatesand venousbloodof50casesofconfirmed peripheral SPD、50controlsof werecollected．Westatistical theclinical healthy analyzed recordsof DNA DNAconcentrationand SPD，extractingrespectively，determination the exon opticaldensity(OD)，Designsusceptibilitygene’S primers，synthetic ofthe primers，amplificationexon，high-throughputsequencing，dataanalysis， themicromutationofthecaseand control，and screening LargeFragment or