中国鲚属鱼类进关系及刀鲚、凤鲚的分子系统地理学研究
中国鲚属鱼类进化关系及刀鲚、风鲚的分子系统地理学研究
中国鲚属鱼类进化关系及刀鲚、凤鲚的分子系统地理学研究
摘要
鱼类的系统发育关系和种间的分类地位,并探讨了湖鲚和短颌鲚的物种有效性。
同时以刀鲚(Cnasus)和风鲚(C
mystus)为研究对象,通过线粒体DNA和ISSR
标记技术,探讨了中国长江流域以及西北太平洋刀鲚群体的系统地理格局;以形
态学分析、线粒体DNA和AFLP技术探讨了中国沿海风鲚群体的遗传结构差异和
地理分布格局。
1.中国鲚属鱼类的系统发育研究
(1)通过形态学方法探讨了5种鲚属鱼类的系统发育关系和种间的分类地位。
聚类分析结果表明湖鲚、短颌鲚与刀鲚的亲缘关系紧密,而与风鲚和七丝鲚亲缘
关系较远。聚类分析、主成分分析的结果及分节特征的分布频率显示刀鲚、湖鲚
与短颌鲚间亲缘关系较近,可能为同一物种。
了中国鲚属鱼类的系统发育关系。短颌鲚、刀鲚、湖鲚的个体间遗传距离非常接
近于这三者的种间遗传距离;而短颌鲚、刀鲚与湖鲚的风t值也显著低于这三者
与七丝鲚(Coilia
树中,刀鲚、短颌鲚和湖鲚未能各自形成单系群。刀鲚、短颌鲚与湖鲚的AMOVA
分析结果显示种间的分子差异仅占9.76%,且统计检验不显著。Fst值变化范围
和AMOⅥ~分析的统计检验结果表明短颌鲚、刀鲚与湖鲚之间无显著的遗传分
化。因此,短颌鲚和湖鲚应为刀鲚的不同生态型种群,而不能作为独立的种。
(3)应用AFLP分子标记技术对5种鲚属鱼类的系统发育关系进行了分析。结
果显示:刀鲚、短颌鲚和湖鲚的种间平均遗传距离和基因分化系数明显低于它们
与七丝鲚和风鲚间的比较结果。将短颌鲚与湖鲚被视作刀鲚的种群,对刀鲚、七
丝鲚与风鲚来进行AMOVA分析的结果显示分子差异主要属于种间差异,且统
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计检验结果显著。NJ系统发育树与UPGMA系统树的结果也显示出湖鲚、短颌
鲚与刀鲚的亲缘关系紧密,而与风鲚和七丝鲚亲缘关系较远。据此推测短颌鲚、
湖鲚与刀鲚应属于同一个种。
2.刀鲚的分子系统地理学研究
(1)利用线粒体DNA控制区片段及Cytb片段对刀鲚的11个群体进行了分析,
基于BI法构建的系统发育树中,刀鲚群体113个控制区单倍型聚为3个类群。
中性检验的结果都表明三个类群都经历过群体扩张。根据贝叶斯系统发育树划分
为三个组群进行AMOVA分析的结果显示三个组群间存在显著的遗传结构。更
新世冰期导致长江河流湖泊的隔离可能使刀鲚分化出的淡水生态型。更新世冰期
晚期,日本海的剧烈波动以及有明海的特殊地理环境可能是日本刀鲚群体发生隔
离的重要原因。此外,刀鲚洄游的生活史特性也影响3个类群在地理上的分布频
率。
(2)基于ISSR分子标记开展了西北太平洋刀鲚种群遗传结构及其地理分布格
局研究。UPGMA系统树与PCA分析的结果显示日本有明海群体与中国群体间
呈现显著的遗传分化。STRUCTURE分析结果表明刀鲚5个群体应分为2个遗传
上不同的组群;AMOVA分析的结果也表明了两组群间存在显著的遗传差异。基
因流结果显示刀鲚的日本有明海群体与中国群体间的基因交流受到限制,而中国
群体间的基因交流频繁。更新世晚期日本海平面的剧烈波动导致的栖息地隔离,
以及较强的海洋环流可能限制了中日群体间刀鲚的基因交流,刀鲚的栖息地和生
活史特征导致的基因同质可能是中国群体间基因交流频繁的重要原因。
(3)应用ISSR分子标记对长江流域刀鲚种群遗传结构及其地理分布格局进行
了研究。STRUCTURE分析结果表明刀鲚的5个群体应分为2个遗传上不同的组
群。AMOVA分析的结果也表明了两组群间存在显著的遗传差异。刀鲚群体
UPGMA系统树中,安庆、天鹅洲和赤壁群体大部分个体聚为一支,镇江与太湖
群体聚为另一支。本研究结果表明刀鲚群体间存在显著的遗传分化。长江河流湖
泊的隔离可能使刀鲚分化出淡水生态型,并且这种分化可能与更新世的气候波动
有关。
3.凤鲚群体的形态学、遗传学研究
(1)对中国沿海的5个凤鲚群体进行了形态学研究。聚类分析表明凤鲚的宁波
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群体与其他群体间差异显著。单因子方差分析也显示出宁波群体与其他的风鲚群
体之间存在差异。与其他凤鲚群体相比,宁波群体在上下鳃耙数和脊椎骨数等分
节特征的分
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