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基于icox1i基因的贻贝科遗传差异及系统发育关系.pdf
江苏农业科学 2015年第43卷第10期 — 23—
朱 明,孟学平,赵 军,等.基于cox1基因的贻贝科遗传差异及系统发育关系[J].江苏农业科学,2015,43(10):23-27.
doi:10.15889/j.issn.1002-1302.2015.10.006
基于cox1基因的贻贝科遗传差异及系统发育关系
1 1 1 2
朱 明 ,孟学平 ,赵 军 ,杨官品
(1.淮海工学院海洋学院/江苏省海洋生物产业技术协同创新中心/江苏省海洋资源开发研究院,江苏连云港222005;
2.连云港龙源生物科技有限公司,江苏连云港222000)
摘要:基于线粒体DNA的细胞色素C氧化酶亚基1基因(cox1),分析贻贝科8个属中13个物种的种间、种内遗
传差异及系统发育关系,结果表明,属间遗传距离为0.245~0.630,平均为0.487;同物种的母系和父系cox1遗传距离
为0.21~0.24;新西兰绿唇贻贝与资料中的绿唇贻贝和Pernaperna聚为1支,支持率为100%,后与翡翠贻贝聚为1
支;13个物种中,除Trichomyahirsuta与贻贝属种类聚为 1支外,其余各属均聚为单系支,贻贻属Mytilus、股贻贝属
Perna、肌蛤属Musculista3个属遗传关系近。
关键词:贻贝科;cox1基因;绿唇贻贝;遗传差异;系统发育
中图分类号:S917 文献标志码:A 文章编号:1002-1302(2015)10-0023-05
贻贝科属于软体动物门瓣鳃纲贻贝目(Mytiloida),现有
[1] 1 材料与方法
33个属约 250个种 。新西兰绿唇贻贝 Pernacanaliculus
(Gmelin,1791)、翡翠贻贝Pernaviridis(Linnaeus,1785)隶属 1.1 试验样本
于贻贝科股贻贝属(Perna),紫贻贝Mytilusgalloprovincialis 绿唇贻贝6个个体,采于新西兰奥克兰;翡翠贻贝18个
(Lamarck,1819)属于贻贝属(Mytilus),翡翠贻贝和紫贻贝是 个体,采于福建厦门;紫贻贝15个个体,采于江苏连云港。取
[2]
我国主要养殖的2种贝类 。翡翠贻贝自然分布于西太平洋 闭壳肌备用。
及印度洋热带和亚热带海域,我国主要分布在东海南部及南 1.2 DNA提取、PCR扩增及测序
海;紫贻贝在世界上分布范围非常广,在我国被认为是1个外 采用CTAB法裂解组织,酚-氯仿抽提、乙醇沉定法获得
[3]
来种,目前南北沿海均有分布 ;新西兰绿唇贻贝是股贻贝 总DNA。绿唇贻贝和翡翠贻贝cox1片段长为750bp,扩增所
属中新西兰特有的1个物种,是新西兰的重要海产种质[4-5], 用引物为ACOIF:5′-CGDATTCARCTWTCTCAYCCHGG-3′
其脂溶性提取物有显著的抗炎作用,对慢性关节炎具有很好 和ACOIR:5′-AMMGTAAAYATRTGRTGMGCCC-3′;紫贻贝
[6]
的疗效,在生活中得到广泛应用 ,新西兰年养殖产值为 1. cox1片段为 889bp,扩增所用引物为 Med-cox1-F:5′-
[7]
90亿美元 。有关贻贝科物种群体遗传差异研究有许多报 TGGGGTCTGAGGAGGTTTGT-3′和 Med-cox1-R:5′-
道[8-11],如位正鹏等基于cox1基因研究了股贻贝属3种贻贝 CCCTGTAGGGACTGCGATTA-3′。PCR扩增程序:94℃变性
[12]
的系统关系 ,刘君等研究了cox1基因在贻贝科鉴定中的
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