第二章核酸分子杂交副本解析.pptVIP

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  • 2016-11-03 发布于湖北
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与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点: 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造成样品和探针的损失,使灵敏度下降,而RPA将所有杂交体系进行电泳,故损失小,提高了灵敏度。 由于PCR扩增过程中效率不均一和反应“平台”问题,基于PCR产物量进行分析所得数据的可靠性将下降,而RPA没有扩增过程,因此,分析的数据真实性较高。 由于与反义RNA探针杂交的样品RNA仅为该RNA分子的部分片段,因此,部分降解的RNA样品仍可进行分析。 步骤较少,耗时短。与Northern杂交相比,省去了转膜和洗膜的过程。 RNA-RNA杂交体稳定性高,无探针自身复性问题,无须封闭。 一个杂交体系中可同时进行多个探针杂交,无竞争性问题。 检测分子长度可以任意设置,灵活性大。 RPA的缺点是需要同位素标记探针。 (三)引物延伸分析法(primer extension analysis) 可用于RNA 5’端的定位和定量,确定转录的精确起始。并可检测mRNA前体和剪接加工中间体。 待测RNA与过量的5’端标记的单链DNA引物杂交,随后用反转录酶延伸引物,合成与RNA互补的cDNA。通过变性的PAGE检测cDNA的长度,即可反映引物末端的标记核苷酸与RNA 5’端的距离。 * 尽管取得了上述重大进展,但分子杂交技术在临床实用中仍存在不少问题,必

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