利用建兰转录数据开发genic-SSR标记.pdf

_=…；； on¨ne 囊叠耋麓赣攥譬蠢 一， system：http：，，＼^n^nⅣ．Iabiotech．org ㈤=m……∞， 簇 啊洳 枷一麓霜!獭蠹y ，i№量 利用建兰转录数据开发genic—SSR标记 李小白卜金凤2金亮3马广莹3 +通讯作者，hufanfhl982815@gmail．com 摘要建兰(qm6idi“me凇扣跣“m)因基因组信息缺乏导致其分子标记的开发和利用受到一定限制。为 了开发可靠、有效的分子标记，本研究对建兰转录组进行了大规模测序，并对此数据进行简单重复序列 (simplesequence 个建兰品种中进行扩增验证，结果发现，61对引物成功扩增，其中39对引物有多态性，其多态信息含量 info蛐ation 00lymo印hism ontolo觇 of GO)、真核细胞的直系同源组(eul(a巧oticorchologousgmups，KOGs)和代谢途径(kyoto encyclopedia and genes 以上结果表明，来自于建兰转录组的39对引物不但具有一定的多态性，而且通过注释赋予了其许多基因 功能的信息，是图谱构建和基因定位的理想分子标记。由于这些引物具有一定的通用性，还可用于整个 兰属遗传多样性和群体结构的分析。 关键词建兰，分子标记，基因内部微卫星，功能注释 Genic—SSRMarkers仔om Databasein EXplomg Transcriptomic 咖而边Mme邢洳死配m LIXiao—Bai卜JINJIN MA Fen矿 Lian93 Guang—Yin93 l Institute ofLife 31002l，China；2 Sciences，Hubei ofHorticultIlre，zhejiangAcademyofAgriculnlralSciences，Hangzhou CoUege University’ wuhan Cen仃e 3 430062，China；3Research＆Developm蚰t Academy sciences，Hangzhou11202，China ofFlower，zhejiangofA鲥cultulraI +Co玎esponding author，hu‰fanl982815@gnlail．com Abstract tothelack resource，the and of Owing of回m6i击ume琊洳Zi“mgenomic developmentapplication molecularmarkershav