基于10个棉花腺体相关材料转录组的EST-SSR标记开发.pdf

棉花学报 cottonscience 2015，27(1)：1—8 基于10个棉花腺体相关材料转录组的 EST—SSR标记开发 程海亮，陆才瑞，邹长松，余道乾，姜鹏飞，杨文翠，张友平，王巧连，宋国立+ (中国农业科学院棉花研究所／棉花生物学国家重点实验室，河南安阳455000) 摘要：棉花是重要的经济作物，但有毒棉酚的存在，使棉子得不到充分的利用，所以低酚棉育种是棉花育种的 重要内容之一。色素腺体是棉酚的储存器官，开发功能型分子标记，加密棉花遗传图谱对色素腺体和其他重要 性状相关基因的研究具有重要作用。本试验以lo个有腺体和无腺体材料转录组信息为基础开发EsT—ssR标 记，在12895条1 15．99 kb。得到的EsT—ssR中，二碱基和三碱基重复是主要的重复类型，分别占30．85％和48．97％，AT／TA和 GAA／cTT分别是二碱基和三碱基的优势重复类型。对长度≥20bp的ssR共设计合成了56对引物，在这10 个材料中进行检测，能扩增出清晰条带的有38对，占67．86％，其中呈多态性的有9对，占23．68％，并对其所在 的unigene功能和表达量进行了初步分析。本研究进一步证明了棉花EsT—ssR标记开发的可行性，并且为棉 花高密度遗传图谱和腺体相关基因的研究奠定了基础。 关键词：棉花；EsT．ssR标记；多态性；色素腺体 中图分类号：S562．035．3文献标志码：A 文章编号：1002—7807(2015)01—0001．08 OfEST．SSRMarke鸭inCOttonBased0nthe InformatiOn DevelOpment T隐nsCr．ptome Of10GIand．陀IatedMaterials ChengHailiang，LuCaimi，Zou Changson＆YuDaoqian，JiangPengfei，YangWencui，ZhangYouping， Guoli+ WangQiaolian，Song ofCo∞nResearch (1nstimte ofChinese of sciences，state Conon AcademyA伊iculture Key匕bomto哆0fBiology，Anyang， Hena玎455000，Chfn们 Ab蛐mct：Cononisan economic cottonseedisunderutilizedbecauseofthe oftoxic important crop，howeVer，me presence gossy— low cotton isan ofthecotton ofmolecular p01，so gossypolbreedingimponantpan breeding．Thedevelopment markersand constmctionof res01ution will an roleinresearch to of relative are high geneticmap playimportant genes pigment91ands，which of omer this traits．In EST—SSRmarkersb