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分子生物学_许晓东_3(NXPowerLite).ppt
3 生物信息的传递(上) 3.1 RNA转录的基本过程 特点: RNA是按5‘-3’方向合成的。 以DNA双链中的反义链为模板。 由RNA聚合酶催化。 底物为四种三磷酸核苷(AUGC)。 不需要引物。 3.1.1 模板识别 3.1.2 转录起始 3.1.3 转录延伸 3.1.4 转录终止 3.2 转录机器的主要成分 3.2.1 RNA聚合酶 (依赖DNA的RNA聚合酶 DDRP) 以DNA为模板 5‘-3’连续合成 需要Mg2+或Mn2+ 缺乏外切酶活性,没有校正功能 不需要引物 3.2.2 转录复合物 转录循环理论: 3.3 启动子与转录起始 3.3.1 启动子区的基本结构 3.3.2 启动子区的识别 启动子的功能既受DNA序列的影响,又受其构象的影响,推测RNA聚合酶并不直接识别碱基本身,而是通过氢键互补的方式加以识别。 (类似于酶与底物的结合) 3.3.3 RNA聚合酶与启动子区的结合 3.3.4 -10区与-35区的最佳距离 原核生物中,-10区与-35区之间的距离大约是16-19bp,小于15或大于20都会降低启动子活性。 启动子下降突变: TATAAT-AATAAT 启动子上升突变: TATGTT-TATATT 3.3.5 增强子(enhancer)及其功能 3.3.6 真核生物启动子对转录的影响 3.3.7 转录的抑制 3.4 原核与真核生物mRNA的特征比较 3.4.1 原核生物mRNA的特征 3.4.2 真核生物mRNA的特征 帽子结构可使mRNA免遭核酸酶的破坏,而且有帽子结构的mRNA更容易被蛋白质合成的起始因子所识别,从而促进蛋白质的合成(实验发现mRNA5’端甲基化帽子是翻译所必需的,且有可能是蛋白质合成起始信号的一部分)。 The 5 cap has 4 main functions:Regulation of nuclear export.Prevention of degradation by exonucleases.Promotion of translation (see ribosome and translation).Promotion of 5 proximal intron excision. ——/wiki/5_cap 3.5 终止与抗终止 到目前为止,尚未发现某个单一位点具有特异的转录终止功能。 3.5.1 不依赖于ρ因子的终止 3.5.2 依赖于ρ因子的终止 3.5.3 抗终止 3.6 内含子的剪接、编辑、再编码和化学修饰 3.6.1 RNA中的内含子 真核生物的基因往往是断裂的基因,其转录所形成的RNA前体要经过剪切,将内含子切除后,将外显子拼接起来才能形成成熟的mRNA。 真核基因平均含8~10个内含子,前体分子一般比成熟mRNA大4~10倍。 3.6.2 mRNA的剪接 3.6.3 RNA的编辑、再编码及化学修饰 3.6.4 核酶 核酶(ribozyme)是指一类具有催化功能的RNA分子,通过催化靶位点RNA链中的磷酸二酯键的断裂,特异性地剪切底物RNA分子,从而阻断基因的表达。 按它们的作用方式可分为剪切型(把RNA前体的多余部分切除),和剪接型(把RNA前体的内含子部分切除并把不连续的外显子部分连接起来)。 3.6.5 RNA在生物进化中的地位 Another example where a recoding event (?1 translational frameshifting) sets up a fixed ratio between two polypeptide products is decoding of the E. coli dnaX gene, which encodes two subunits of DNA polymerase III, τ and γ . These two subunits are present in a ratio of 1:1 in the polymerase holoenzyme. The long form, τ, is synthesized by standard decoding. The short form, γ, shares its amino acid sequence with τ for the first two-thirds of the latter but has one additional amino acid at the carboxyl end. With the help of stimulatory signals in the mRNA, 50% of translating ribosome
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