大肠杆菌启动子列特征分析与识别方法的研究.pdfVIP

撼要 !!! 摘 要 本谍题源予国家鑫然稃学基衾项目“复杂系统意义下的生物信息学中若 干问题的研究(No”，主要以大肠杆菌启动予为研究对象，运 用智熊傣患处理方法，对大肠移藏窟动子序列避行分橱和戮究，重点磷究痘 动子穿剿的识溺闻粼。论文取得的主要研究成聚如下： 1．本文应用变输入长度和滑动空位方法建立了基于神经网络的大肠 释蓥痿凌予谖爨模黧，壤据大黪疆蔻墓嚣分孑玺秘学鸯荚理论与统诗事 实，对扁动子序列组件进行研究和分析。研究发现，除两个显著保守序列 特征组件外，其它几个非显著序列组件包含的特征信息对大肠杆菌启动予 的识剜识有一定的影晌。 2，本文提出基于数据优化的大肠杆菌启动子识别方法，并基于该方法 秘BP毒枣经网络建立了大瑟耪蘩襄动子谖爨模型(Data Optimization Network Neural 杆菌启动予序列和相应长度的编码区序列为正负样本，在神经网络分类器 遗彳亍训练之蓊，透遗权值矩阵穰凝(wMM)优亿调练集群本，将处遴过 的数据粲作为神经网络的训练样本。研究结粜表明，采用数据优化法建立 的毒枣经网络分类器冀蠢较高豹敏感度秘综合辨谈壤度。 Vector Machine，SVM)方法用于大肠 3．本文将支持向薰机(Support 杆菌启动予的识别中，从数据库中选取一定长度的正样本序列和负样本序 歹l，按3：|鹣魄铡分贼硼练集和溺试集，建立了基于支特国爨撬酶分类嚣。 实验研究结果表明，艇于支持向缴机的识别方法优于传统的神经网络识别 模型，袭蹰其在生物傣息学中蠢良好斡应用{；蓼最。 大肠杆蓠寤动予的识剐阐越怒生物信息攀研究韵重要问题之一。本文的 研究对探索启动子的识别具有参考价值。 关键谣： 大弱程萤麓动子，BP静经阚络，数箨傀亿，支持离囊橇，识弼 Abstract Science from Nature This isderivedCountry project inthesenseof ofsome inbioinformatics complexsystem(No． “Researchingproblems Promoter are Coli this Escherichia sequences by ”．Inpaper，the analyzed information the is of method，and recognition usingintelligent processing emphases as E，coli maincontentsofthis follows： promoter．The paper architecture 1．Inthis of network