肝癌化疗栓塞术前后血清蛋白质组学的分析.pdfVIP

复旦大学博士论文 中文摘要 经导管动脉化疗栓塞术(TACE)是目前公认的非手术治疗肝癌和肝转移癌 的首选方法。目前在TACE术后评判肝癌转移、复发的手段主要是综合运用影像 学和血清学相结合的方法，要求肝癌患者TACE术后定期复查B超、CT、MR等， 对AFP阳性的病人则定期复查血清AFP值。甲胎蛋白(AFP)多年来被作为初筛诊 断肝癌的首选指标，但有20％～40％的肝癌患者AFP阴性或低值。 新兴的蛋白组学，是对基因组所编码的所有蛋白质进行研究的学科。通过 蛋白质组学使我们对肿瘤的发生、发展有了更详尽的理解，并能够通过发现特 异的分子标志物来预测患者预后和治疗效果。 C1inProt技术(液体芯片一飞行时间质谱技术)磁珠分离系统、质谱系统、 分析软件和可选的体液样品自动处理系统组成，是蛋白质组学新兴运用的技术， 己有众多的研究组利用该技术在患者体液中发现了能够早期诊断肿瘤的标志 物。本课题研究目的就是希望在该技术的基础上寻找介入治疗预后与疗效判断 相关的分子标记物，并对对有意义的差异蛋白进行鉴定。 第一部分ClinProt技术平台的建立及肝癌门静脉癌栓血清标记物的初步研究 目的建立稳定的C1inProt液体蛋白质芯片技术平台，选择最优化的条件， 评价该平台的重复性，进而借此平台研究肝癌门静脉癌栓(PVTT)形成相关标志 物并建立预测模型。 材料和方法选取健康体检者血清，采用磁珠分离系统纯化，基质辅助激光解 技术参数评估该技术的稳定性和可靠性。采取无PVTT和有PVTT肝癌患者血清 各20例及体检健康者血清，采用该技术平台建立其血清多肽谱，通过神经网络 算法(SNN)建立肝癌门静脉癌栓诊断模型并进行验证。 结果我们总结出最佳点样体积比例是样品：基质=1：5(u1)、温度和湿度控制 在20℃-25℃和30％一50％时，结晶效果最佳，质谱出峰情况最好。该平台日内重 复性和日间重复性均小于23％，达到蛋白质组学实验的标准。通过对无PVTT和 有PVTT患者血清多肽谱的检测，发现蛋白质峰质荷比(M／Z)主要集中在 05)，通过神经网络算法(SNN)建立图谱诊断模型，筛选出建立模型选用的特 征峰：1466．52m／z、5823．1m／z、8933．09m／z、5353．95m／z、4055．19m／z、 4420．43 m／z，5337．19m／z，和4091．46m／z。模型训练集的判断准确性对于无 门静脉癌栓组为92．86％，PVTT组为92．86％。模型测试集的判断准确性对门静脉 癌栓组为83．3％，无PVTT组为100％。 结论磁珠分离结合MALDI—TOF—MS的C1 inProt蛋白质组学研究平台有良好的 可操作性和重复性、特异的判别模型，为肝癌基础研究提供了新的手段。诊断 模型可能对预测门静脉癌栓的形成具有重要临床意义。 关键词原发性肝癌，门静脉癌栓，C1inProt系统，蛋白质组 中图分类号R815 复旦大学博士论文 第二部分肝癌介入前后的血清差异蛋白组学初步研究 目的对一组肝癌患者介入治疗前后血清蛋白谱进行比对，寻找肝癌介入治疗 相关的血清标记物。 材料和方法选取TNM分期为I、Ⅱ期肝癌患者20例，分别在首次介入前一天 者行第二次介入TACE术治疗，于第二次介入术后45天(t2)第三次采集静脉 血。采用采用磁珠分离系统纯化，基质辅助激光解析电离飞行时间质谱 (MALDI—TOF—MS)测定其血清多肽谱，并进行前后比较，寻找蛋白峰差异。 结果本组20例患者共行TACE术62次，平均9．9个月行介入治疗3．1次， 患者全部存活，3例行外科根治性切除治疗，1例行肝移植治疗，3例PD，11 例SD，2例PR。1例患者出现肝内动门脉瘘，无患者出现门静脉癌栓和远处转 利用3883、5634m／z进一步验证，该蛋白峰有一定区分价值。 61 12m／z蛋白峰差异显著，可能有其潜在的临床应用价值。我们拟在下一步实验 中对3883Da峰进行鉴定。 关键词原发性肝癌，经动脉化疗栓塞治疗，ClinProt系统，蛋白质组学 中图分类号R815 第三部分介入治疗相关的差异蛋白鉴定 目的对所发现的3883Da的蛋白进行鉴定，并初步推测其在肝癌及肝癌介入治 疗前后的临床意义。 材料和方法：选取上一部分研究中3883Da蛋白波峰值最明显者血清