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核酸研究，2001，卷29，号 1，11-16 2001 牛津大学杂志 NCBI的数据库资源 David L. Wheeler*, Deanna M. Church, Alex E. Lash, Detlef D. Leipe, Thomas L. Madden, Joan U. Pontius, Gregory D. Schuler, Lynn M. Schriml, Tatiana A. Tatusova, Lukas Wagner and Barbara A. Rapp 2003年接收，2003年10月收录 摘要： 除了维持GenBank 核酸序列数据库之外，NCBI还提供数据分析与GeneBank上运行数据的返回资源以及通过NCBI网站的大量的其他生物资源。NCBI的返回资源包括Entrez,PubMed,LocusLink,TaxonomyBrowser. 数据分析资源包括BLAST,ElectronicPCR,orfFinder,RefSeq, UniGene, HomoloGene, Database of Single Nucleotide Polymorphisms (dbSNP), Human Genome Sequencing, Human MapViewer, GeneMap’99, Human–Mouse Homology Map, Cancer Chromosome Aberration Project (CCAP), Entrez Genomes, Clusters of Orthologous Groups (COGs) database, Retroviral Genotyping Tools, Cancer Genome Anatomy Project (CGAP), SAGEmap, Gene Expression Omnibus (GEO), Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM), the Molecular Modeling Database (MMDB) and the Conserved Domain Database (CDD).增大许多网页应用是BLAST的惯用补充，这优化了查询特殊的数据。所有的资源都可以通过NCBI的主页获得，网址是：. 前言： 位于国家卫生局的NCBI是为了发展分子生物学的信息系统而创立于1988年。除了维持直接隶属于科学组织的GenBank的核酸序列数据库之外，NCBI还要为GenBank数据的电脑资源分析以及大量其它的通过NCBI可用的生物数据提供返回资源。 NCBI主页上的可用资源有全部基因组中的部分基因的代表性短序列，蛋白质结构和混乱基因的临床描述。NCBI提供了一系列的计算机资源以支持各种类型的数据分析。从这个概观来看，NCBI的数据资源可以化为七类：资源返回系统，序列相似性查询程序，应用基因水平序列分析的资源，化学序列资源，基因组大小分析的资源，基因表达育表型分析资源，蛋白质结构与模建资源。有表格提供对这些资源的浏览。 基因库相关工具： Entrez: Entrez是一个整合的数据库返回系统，可以通过以下链接得到：DNA和蛋白质序列，基因图谱， 人口设定，MMDB上的蛋白质结构，PubMed和OMLM上的生物医学数据，以及NCBI上的分类廉洁。Entrea中的序列 ，尤其是蛋白质序列是从大量的数据库资源获得的[包括GenBank蛋白质翻译，蛋白质鉴定资源，SWISS-PROT，蛋白质研究基地，蛋白质数据库与RefSeq]，因此比单独的GenBank拥有更多的序列数据。PubMed包括MEDLINE上主要的一千零七万参考文献和摘要，以及网上1100多种可用杂志的全文。 Entrez利用简单得Boolean咨询以及相关信息的深入链接提供了序列或者纪录文本的全文查询。有些链接是简单的前后参考，例如，从一个序列链接到收录的论文的摘要，从蛋白质序列到相关的DNA序列，或者是到其他序列的排列。其他的链接是基于编辑的序列的相似性或者MEDLINE上的摘要。这些前编辑的“邻居“为浏览一组相关纪录提供了快速通道。有一种叫做linkOut的服务扩大了从单个数据库记录到相关外部服务的外部链接范围，这其中包括生物—-特定基因组。 分类浏览器： NCBI的分类检索数据库对多余7900种生物作了索引，这些生物都至少有一条核酸或者蛋白质序列在序列数据库中被标记。分类浏览器可以用来查看某一特定的生物或者生物群的分类地位，或者返回序列以及结构数据。NCBI研究者是根据生物名字全部，部分拼写的语音发音的顺序进行排序的，并且可以直接链接到生物在生物学领域的普通应用上。新的ntrez分类系统增加展示传统分类树的功能这就给用户展