维持蛋白质结构的作用力教案分析.pptVIP

3 氢键 氢键对蛋白质空间结构的稳定性极为重要，特别是对二级结构的形成起着关键的作用。 Bryan 等人用随机突变的方法诱变枯草杆菌蛋白酶BPN的基因筛选到的一个耐热突变型蛋白酶序列, 测定表明是其218 位的一个Asn 变成了Ser。该突变酶的 1.8A 分辨率的空间结构测定表明 Asn218变为 Ser218 后使得蛋白质结构中的一条β链中的另外两对氢键的几何构型得到改善，因此分子内的氢键的增加使得蛋白质结构更加稳定，从而提高了枯草杆菌蛋白酶的热稳定性。 4 二硫键 引入二硫键可以减少蛋白质去折叠的构型熵，因此可以提高蛋白质分子的稳定性。但是引入二硫键的前提是二硫键的引入不能同时增加结构张力。 在蛋白质分子中引入二硫键来提高蛋白质热稳定性的成功实验首先来自于对T4 溶菌酶和l阻遏蛋白的蛋白质工程研究人们将T4 溶菌酶的Ile3 换成Cys3 使之能与第97 位的Cys 形成二硫键 NAD：烟酰胺腺嘌呤二核苷酸 A stereoview showing the extensive hydrogen bonds (dashed lines) made by NAD+ with Leu 179, Ser 198, Glu 199, Arg 204, Leu 266, Leu 268 and Ile 291 (residues shown in pink). Many van der Waal contacts are made with other surrounding residues. The water molecule that is conserved in di-nucleotide binding proteins containing the Rossmann fold is also shown. In TkTDH, this water forms four hydrogen bonds to the oxygen of Gly 175, the nitrogen of Gly 180, the oxygen of Phe 243 and an oxygen of the first phosphate group of NAD+ (residues shown in red). The active site of PhTDH. (a) The conserved residues at the active site. Dotted lines are ionic bonds drawn between Glu68 and Lys342, and Glu152 and Arg294. Structure of the hydrophobic cluster. The cis peptide at Trp297 (orange) is in the catalytic domain. Trp137, Trp297, Trp300 and Tyr301 are forming a hydrophobic cluster. Structural zinc site and lobe loop (residues 97–111). The structural zinc ion is shown in gray. The coordinate bonds are represented by pink lines. 维持蛋白质结构的相互作用力 一、共价相互作用：（二硫键） 二硫键在胞外蛋白和胞内蛋白中的功能 二硫桥作为蛋白质结构花样的组成部分 蛋白质结构中原子间的相互作用可分为两类：共价相互作用和非共价相互作用。 二硫键(-S-S-)又称作二硫桥或硫硫键：是指两个硫原子之间形成的化学键其键能很大，大约为30~100Kcal/mol ，因此是一种很强的化学键。它可以把不同的肽链或同一肽链的不同部分连接起来对稳定蛋白质的构象起着重要的作用。 二硫键的形成：在细胞外大多数二硫键的形成是自发地，而在细胞内它需要细胞膜上的酶系统来将二硫键引入蛋白质。因为细胞是依靠很强的还原环境所维持的，例如5mM的还原谷胱甘肽和0.01mM 的氧化谷胱甘肽，在这样的条件下蛋白质中二硫键的形成就不是自发的了 二硫键在胞外蛋白中的功能：在胞外蛋白中二硫键决定了胞外蛋白的机械性质 例如：角蛋白 蛇毒毒素蛋白和其它的毒素蛋白、多肽激素消化酶、免疫球蛋白、溶菌酶以及牛奶蛋白等，在这些蛋白质中二硫键的作用对于结构的稳定 Schematic models of an antibody molecule and a Fab fragment 二硫键在胞内蛋白中的功能：二硫键决定了胞内蛋白的化学性质，新合成的蛋白很少具有二硫键，