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16个蝴蝶兰品种EST-SSR遗传多样性分析.pdf
植物遗传资源学报2013ꎬ14(3):560 ̄564
Journal of Plant Genetic Resources
16个蝴蝶兰品种EST ̄SSR遗传多样性分析
张水明ꎬ陈 程ꎬ陈芳芳ꎬ汪 天
(安徽农业大学园艺学院ꎬ合肥230036)
摘要:利用NCBI上提供的8188条蝴蝶兰EST序列开发EST ̄SSR 引物ꎬ用来分析市场上较常见的16 个蝴蝶兰栽培品种
的遗传多样性ꎮ 成功开发出9对多态性引物ꎬ这9对引物在16 个蝴蝶兰品种上共检测出45 个等位基因ꎬ每对引物可检测等
位基因2~12 个ꎬ平均为5 个ꎻSSR 引物多态性信息量(PIC)变化范围为0527~0981ꎬ平均为0755ꎻ16 个蝴蝶兰品种间的遗
传相似系数在0550~0875之间ꎬ平均为0728ꎬ表明供试品种间的亲缘关系较近ꎮ UPGMA 聚类分析结果表明ꎬ在遗传相似
系数为070 处可将16 个蝴蝶兰品种分为4 大类ꎬ第Ⅰ类包括满天红、巨宝红玫瑰等10 个品种ꎬ第Ⅱ类包括夕阳红、富乐夕
阳、昌新皇后和新原美人4 个品种ꎬ第Ⅲ类包括萨拉黄金1个品种ꎬ第Ⅳ类包括台湾阿妈1个品种ꎬ聚类结果与花色特征比较
一致ꎮ 该研究结果对蝴蝶兰品种选育有一定参考价值ꎮ
关键词:蝴蝶兰ꎻEST ̄SSRꎻ遗传多样性ꎻ聚类分析
Analysis of Genetic Diversity of 16 Phalaenopsis
Cultivars Using EST ̄SSR Markers
ZHANG Shui ̄mingꎬCHEN ChengꎬCHEN Fang ̄fangꎬWANGTian
(College of HorticulturalꎬAnhuiAgricultural UniversityꎬHefei230036)
Abstract:Nine polymorphic primer pairs were developed from 8ꎬ188 ESTs of Phalaenopsis from NCBI and
were used to analysis genetic diversity of 16 common Phalaenopsis cultivars from the market.The results indicated
that45 alleles loci were detected across9 EST ̄SSR loci.The average number of alleles per EST ̄SSR locus was5
with a range from 2 to 12.Each value of allelic polymorphism information content (PIC) ranged from 0527 to
0981based on an average of 0755 per EST ̄SSR marker.The genetic similarity of paired cultivars varied from
0550 to0875ꎬwith an average of 0728.The results showed that the commom Phalaenopsis cultivars from the
market had closer genetic relationship among most cultivars.Clustering analysis based on the UPGMA method re ̄
vealedthatthese16Phalaenopsis cultivarscouldbedividedintofourgroupsatsimilaritiescoefficientof070ꎬwhich
wasgenerally consistentwithcolor.Thegroup ⅠincludedtencultivarsꎬsuchasDtps.Queen Beer ‘RedSky′ꎬDtps.
Jiuhbao Red Roseꎬet al.Thegroup Ⅱincludedfour cultivarsꎬsuch asP.T
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