発現データからのガン細胞分類 - bic.kyoto-u.ac.jp.pptVIP

分子生物情報学(7)遺伝子発現データの情報解析法スケールフリーネットワーク 京都大学　化学研究所 バイオインフォマティクスセンター 内容 遺伝子発現データ解析 遺伝子ネットワーク推定 腫瘍細胞分類 スケールフリーネットワーク 遺伝子発現データの解析 DNAチップ?DNAマイクロアレイ 多数の遺伝子の発現量を同時測定可能 遺伝子発現データ解析 クラスタリング どの遺伝子が似ているか？ 遺伝子ネットワーク推定 どの遺伝子がどの遺伝子を制御しているか？ 腫瘍細胞分類 腫瘍のより細かな分類、抗がん剤の適切投与 遺伝子ネットワーク推定 ネットワークモデル?推定手法 ブーリアンネットワーク 微分方程式系（線形?非線形） ニューロ型モデル 時系列解析 ベイジアンネットワーク グラフィカルモデリング ブーリアンネットワークの例 状態遷移 状態遷移 初期状態が与えられれば、状態遷移表より、どのような変化がおきるかがわかる アトラクター：同じ状態系列が繰り返される 011 ? 010 ? 101 ? 010 ? 101 ? … 111 ? 110 ? 100 ? 000 ? 001 ? 001 ?　001 ? … ブーリアンネットワークの同定 時刻 t, t+1 の状態の組（遷移表の一部）　?　例 例に無矛盾なネットーワークが一意かを判定 例は発現パターンの変化に相当 入次数 ネットワーク形状に制